线粒体相关期刊投稿经验

线粒体相关期刊投稿经验

1、Small Methods：一本综合性sci期刊，最新IF=12.13，收录范围：材料科学、生物医学、化学和物理等各个领域的纳米级和微米级的研究方法的重大进展，比如X射线、电子衍射、层析成像方法、扫描探针技术、波长色散X射线能谱、扫描隧道显微镜、单细胞方法、基因编辑等等。

2、International Journal of Molecular Sciences：最新IF=4.556，收录范围：分子相关的科学研究，包括生物学、化学和医学领域的基础研究、实验技术研究、理论研究等。

3、Cell Proliferation：最新IF=5.75，主要接收干细胞，再生医学，组织工程，细胞周期控制，细胞衰老，细胞死亡，数学建模等领域的研究。

4、Npj Breast Cancer：最新IF=6，收录任何和乳腺癌相关的主题，包括乳腺癌的影像学、免疫疗法、疾病的分子分类、信号通路、遗传易感性和分子流行病学在内的致癌作用、转移机制、肿瘤微环境等等。

5、Frontiers in Cell and Developmental Biology：最新IF=5.201，主要接收分子医学、分子与细胞肿瘤学、细胞生长分裂、细胞存活与凋亡、细胞生物化学、细胞粘附和迁移、表观遗传学、表观基因组学、干细胞研究、线粒体研究、进化发育生物学等13个相关领域的学术论文。

6、BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS (BBRC)：最新IF=2.985，大家熟悉的研究生之友。

审核比较快的期刊，这个其实没有多快的，都是比较慢的，都是在3-4个月左右，慢的有的得5-6个月，也是有的。快的可能是2个月吧。这个也没有一个期刊名单说哪个期刊审核比较快，不是说二区三区的就审核慢，四区的就审核快，不一定的，不同的刊物不一样的。如果你着急发表，去淘淘论文网上看下，那边有一些可以相对快一点发表，也只是相对快而已。

常有人问：你发表了文章，你否在该杂志社有关系。我肯定地说：“我不认识杂志社的人，只要你的文章质量高，一定有地方发表”。又有说，我的文章投出去怎么就没有发表，有多种原因：你的文章质量不高；虽然质量高但投错了地方，不信你将一篇研究中学化学教学的论文投到《有机化学杂志》看结果如何，这就是投错了地方。下面结合笔者自己的体会，谈谈怎样提高投稿的命中率。大多数报刊杂志都有相对稳定的作者群和稿源，要在激烈的用稿竞争中获胜，为自己争得一席之地，使自己的作品尽可能变成铅字，让你的研究成果为更多的人认可和受益，也让大家与你共同分享成功的喜悦，投稿时须注意以下5个问题： 1.投稿要对路 每种报刊杂志都有自己特定的办报（刊）方针和宗旨，有自己的读者对象，投稿前必须先对此进行了解，搞清它的发行出版周期是双月刊、季刊、月刊还是半月刊、周刊，如果是报纸的话，是日报、周二报、周报还是半月报、月报，接下来要了解各种报刊都开设了哪些栏目，各栏目都发表些什么样的文章，可能的话还应该了解一下报刊的办刊历史，看看近年都发表过什么样的文章，对照一下你研究的问题以及撰写的论文原来有没有人研究过写过，研究现状如何，原来发表过的此类文章是从哪些角度写的，你的文章有无创新发展。此外，还应对报刊的发稿动态和走向以及下一步热点稿件是哪一类进行研究，最后看看你撰写的文章适合于哪些报刊的哪些栏目，投寄时最好在信封上注明栏目名称，以便于编辑人员及时准确地处理稿件。要做到这一点，平时对有关报刊必须多看、多翻阅， 至少对近期目录做到心中有数，这样投稿时才能做到有的放矢，不致于把中学化学教学方面的稿件寄给适合小学生阅读的报刊。 例如：中学化学教学研究的权威杂志——《化学教育》是中国化学会主办的综合性学术月刊。经常在每年第一期刊登《化学教育》栏目简介，《化学教育》征稿简则。如果要向这家杂志投稿，就必须仔细研究这两篇文章。其它几家杂志如：中学化学教学参考、中学化学等也会对其读者对象、投稿要求、杂志栏目等方面进行介绍。 2.注意把握时机 教研论文按时效性大体可分为两类：一类时效性强，与教学进度配合（例如《中学化学教学参考》的新教材教学参考，各种同步练习等），另一类时效性不强，与教学进度无关。后者什么时候投稿都行， 而前者必须掌握一定的提前量，到底提前多长时间投稿，一般报刊都会通过报刊启示提醒读者和作者。正常情况下，如果报刊没有规定，与教学进度配合的稿件，双月刊、月刊应提前4—6个月。总的说来，新闻类稿件越及时越好，报刊发行周期越短，提前量相应要小些。投稿最忌讳“马后炮”，一般不是很出色的稿子，“马后炮”是很难发表的，比如：与下学期一开学要学的内容有关的稿件， 一般在上学期期末最迟在假期当中就要发，这样才能给教师备课提供借鉴和参考，如果你等到教完这部分内容后再写出来投出去，那就成了“马后炮”，这类稿件不是极有价值一般不会保留到第二年再发。这便产生了矛盾，因为大多数与教学进度有关的稿件都是在教学后发现了问题才研究撰写出来的，而此时已经错过了投稿时机。怎么办？笔者的经验是可以先写出来慢慢加工仔细斟酌，到第二年合适的时候再投出去，这样经过冷加工后，稿件会更成熟。有些报刊采用期长达几个月甚至半年，即使只有一个月，由于不能一稿多投，等到收到答复，再投给其它报刊也已错过了时机。这种情况下也可以采用上述办法，只是最好有个发稿记录，记下何时发给谁？结果如何？再投稿时心中有数。 3.注意格式要规范 如果稿件是手写的，要注意书写认真规范，整洁清楚，无错别字，标点符号准确无误，而且必须使用方格稿纸誊清，注明每页字数。如果是打印稿，还应注意字不可太小，一般正文部分以三号字或小三号字为宜，页脚须注明页数与字数，便于编辑排版时参考。一般报刊编辑部都不收复写稿和复印稿。不少报刊编辑部对稿件格式都有详细而明确的要求，投稿前要认真研究。正规论文的格式应该是标题、标题之下是通讯地址、通讯地址之后是加小括号的邮政编码，然后空格后是作者姓名。较长的论文在正文之前应有200—300字的“摘要”，和不超过5个的关键词，以便于编辑阅稿时节约时间，了解要点，通常正文之后还应注明“引文出处”或“备注”以及主要参考书目，参考书目要写清书名、出版社名、版本、编著者等。如果是第一次投稿，最好文后加“作者简介”，以方便编辑了解情况，建立作者档案，同时这也是自我推销的需要。当然，简介必须实事求是，不可海吹，因为稿件最后能否采用，不是看你的简介来决定，关键还是稿件的质量，提高命中率的根本还在于稿件质量。 4.适当控制字数 不同的刊物，对论文字数的要求不同，而且差别很大，有的喜欢长篇大论，有的喜欢短小精悍，投稿时应对各刊物发表的文章进行研究，总结归纳出一些规律，这样投稿才有针对性。一般说来，寄给报刊发表的文章，应尽量短些，选题最好小一点，内容实用些，可操作一些，让别人看了能受到启发教育或拿过来就可以用；而参加评选的论文，理论性应强些，选题可稍大点，字数亦应适当多一些，这样才能将问题说清说透。通常组织论文评选的部门下通知或发启示时，对论文选题、格式、字数都有明确要求，撰写时应充分注意，如果没有要求，笔者以为参加评选的论文字数以3000- 5000字为宜，一般不要少于3000字，也不要多于7000字，根据选题只要论述清楚了就行，不必把过多的注意力放在字数多少上。就发表的文章来看，字数多少的差别亦很大，这主要与选题性质、报刊容量、些读者对象等因素有关，一般理论性较强的选题可稍长些，应用性较强的选题应短些，投给杂志的稿件可稍长些，而投给报纸的稿件应尽量短些，面向教师及研究工作者的论文可稍长些，面向学生的作品应尽量短些，选题较大的、学术性强的论文可稍长些，选题很小、学术性不强的、普及性的作品应尽量短些。这里的“稍长”或“稍短”是相对而言，没有严格规定，在笔者看来，“稍长”一些的文章可掌握在 3000-5000字之间，当然，如果1500-2000字能解决问题则最好；“ 稍短”一的文章以不超过2000字为宜，如果500-1000字顶多1500 字能说清问题则最好。不论哪类文章，在控制字数的同时应十分注意文章的科学性和可读性。所谓科学性是指文章的观点不能出错，引用的论据资料应准确无误，论证过程应经得住推敲；所谓可读性主要是指文字表述要让人喜闻乐读，一看题目就想看内容，一看内容就让人爱不释手，非一口气读完不可，当然这不是一日之功，需要长时间磨炼，文字功底是练出来的。 例如：《化学教育》的“化学与社会”栏目字数应在5000字以内，“复习指导”字数应在3000字内，“调查报告”字数在3000字内，“实验教学与教具研制”字数在500—2000。 5.讲究投稿策略 刚开始投稿的人，将稿子投出后总希望尽快得到编辑部的回音。事实上，由于编辑部每天要处理的稿件无以数计，所以，不少刊物收到稿件后常常连收稿通知都懒得发，这挫伤了不少作者的积极性，甚至有人从此不再写稿。还有个别刊物大量地照顾“关系稿件”，眼睛只盯住几个“名人”，结果使很多新人退避三舍。但应该承认，任何刊物都会考虑自己的信誉，真正有生命力的刊物在用稿上一定会坚持认稿不认人的原则，只要稿件对路时机合适，质量属于上乘之作，任何编辑部都没有舍优求次的道理。基于这种考虑，从撰稿者角度出发，笔者以为，投稿时应注意以下策略：一是持之以恒，管寄不管发，即经常投稿，投出后就不要再去想它，不要指望它一定能发表，压低期望值，用不用让编辑部去考虑，事实上你想也没有用；二是猛打猛冲，以多取胜，越不发越寄，时间长了，编辑就会有印象，特别是一些稿源充足级别较高的刊物，很可能你寄的稿子连仔细看都未来得及就提出了处理意见，“屡投屡退，屡退屡投”就可能感动上帝，如果你写的稿件确有水平，不用说，只仔细看一次就可能改变你的命运，甚至连你以前投的稿子都会引起编辑的注意； 三是认准的路走到底，只要你感到你的稿件确有价值，就可以反复投，也可以转投其它同类刊物，相信是金子就一定有被人发现认可的时候；四是由低到高，循序渐进，一般来说，刊物的级别越低，发行范围越小，稿源越不足，同样质量的稿件投给这样的刊物就可能增加命中的机会，刚开始写稿打知名度的新人尤其应注意这一点，梦想一鸣惊人一口吃成个胖子是不现实的；五是趁热打铁，即收到刊物的采用通知后马上再寄，趁编辑部对你的稿子还有印象，继续开拓。六是注意对准档次，即投稿时注意稿件的质量与刊物的级别影响对应一致，这可以分为两种情况：第一种情况是原来发表过文章有一定知名度的作者，可以“好稿子”对“高级别”刊物，这样可以扩大影响、创牌子、打名声，提高知名度，当然作品一定是“ 拳头产品”，如刊物多次发表过你的稿子属于“熟门熟路”，可采取中档稿子对高级刊物的策略；第二种情况是原来未发表过文章，没有什么名气，门路不熟，属于淌路子的作者，可采用“田忌赛马”的办法，以好对中、以中对低，如此可取得“三局二胜”的效果。 最后说一下“一稿多投”。各刊物都有自己的规定，都反对“ 一稿多投”，都要求过了采用期之后再改投它刊。但是很多稿子时效性很强，特别是配合教学进度的稿件常常是“过了这个村就没那个店”了。在这种情况下，有两个办法：一是按规定办，过期改投或留待明年再投，二是采取变相的“一稿多投”，变通的办法就是作好投稿记录，收到采用通知后立即通知其它刊物，不要再发。一般说来，知名度不大、刚开始写稿的作者，特别是质量一般的稿件，即使一稿多投，也很少会出现几家刊物同时采用的情况。从这个角度出发，从维护作者权益的角度出发，笔者赞成第二种办法，各报刊杂志编辑部似亦不应反对这种办法。要说责任的话，作者写稿很不容易，你不用又不及时通知作者，耽误了用稿时机，这个责任编辑部应该负，不知笔者的看法是否正确。

题目： Zygnema circumcarinatum UTEX 1559 chloroplast and mitochondrial genomes provide insight into land plant evolution 轮藻 Zygnema circumcarinatum  UTEX 1559叶绿体和线粒体基因组为陆生植物进化提供了新见解 发表期刊： Journal of Experimental Botany  发表时间： 2020-3-24   影响因子： 5.36轮藻的完整叶绿体和线粒体基因组为陆地植物的陆生化提供了新的线索。在此，研究者报道了UTEX 1559的细胞器基因组，以及绿藻、轮藻和陆地植物的33个质体和18个线粒体基因组的比较基因组学研究。通过这些质体和线粒体基因组确定基因的存在/缺失。UTEX 1559 (157,548 bp)和SAG 698-1a (165,372 bp)质体之间的比较揭示了非常相似的基因，但是基因组发生了实质性的重排。令人惊讶的是，这两个质体只有85.69%的核苷酸序列一致性。UTEX 1559线粒体基因组大小为215,954 bp，是所有测序轮藻中最大的。有趣的是，这个大的线粒体基因组包含一个50 kb的区域，与任何其他细胞器基因组都没有同源性，其两侧是两个86 bp的正向重复序列，包含15个ORFs。这些ORFs与来自细菌和植物的蛋白质具有显著的同源性，具有诸如引物酶、RNA聚合酶和DNA聚合酶的功能。本研究结论为：(i)先前发表的SAG 698-1a质体可能来自不同的双星藻属 Zygnema 物种，以及(ii)UTEX 1559线粒体基因组中的50 kb区域可能是最近获得的可移动元件。 图1、两种 Z. circumcarinatum 藻种SAG 698-1a(上)和UTEX 1559(下)的MAUVE比对。结果显示了大量的重排和不同的质体长度，表明这些藻种可能不是同种的。A框显示了含有 ccsA 基因和 trnI 基因的区域，这是两个质体之间极少数保存完好的区域。B框显示了一个位于 ndhJ 基因和tRNA， trnL ( uag )之间的大区域，该区域是最大的区域(100kbp)，在该区域内共享保守的基因序列，但在位置上相对于其他区域非常显著地发生了重排。 图2、基于质体基因构建的系统发育图，热图代表基于基因GO的功能基因分组。 图3、基于线粒体基因构建的系统发育图，热图代表基于基因GO的功能基因分组。 图4、本研究包括的线粒体基因组的基因密度图。x轴为每个线粒体基因组中基因序列的百分比。y轴为物种。圆的大小为基因间间隔的百分比(IGS)。圆的颜色代表线粒体基因组大小。除了 A. thaliana 和 Z. circumcarinatum   UTEX 1559以外的所有物种都保持40%或更高的基因密度。UTEX 1559的基因密度为29.4%，不包括移动元件中的基因。当考虑移动元件中存在的额外基因时，UTEX 1559仍然保持低于40%的基因密度。 图5、UTEX 43 1559线粒体基因组中50 kb“基因沙漠”区域示意图。通过ORFfinder和序列相似性搜索，在该区域共发现16个基因(15个CDSs和1个tRNA)。

线粒体相关期刊投稿

1、Small Methods：一本综合性sci期刊，最新IF=12.13，收录范围：材料科学、生物医学、化学和物理等各个领域的纳米级和微米级的研究方法的重大进展，比如X射线、电子衍射、层析成像方法、扫描探针技术、波长色散X射线能谱、扫描隧道显微镜、单细胞方法、基因编辑等等。

2、International Journal of Molecular Sciences：最新IF=4.556，收录范围：分子相关的科学研究，包括生物学、化学和医学领域的基础研究、实验技术研究、理论研究等。

3、Cell Proliferation：最新IF=5.75，主要接收干细胞，再生医学，组织工程，细胞周期控制，细胞衰老，细胞死亡，数学建模等领域的研究。

4、Npj Breast Cancer：最新IF=6，收录任何和乳腺癌相关的主题，包括乳腺癌的影像学、免疫疗法、疾病的分子分类、信号通路、遗传易感性和分子流行病学在内的致癌作用、转移机制、肿瘤微环境等等。

5、Frontiers in Cell and Developmental Biology：最新IF=5.201，主要接收分子医学、分子与细胞肿瘤学、细胞生长分裂、细胞存活与凋亡、细胞生物化学、细胞粘附和迁移、表观遗传学、表观基因组学、干细胞研究、线粒体研究、进化发育生物学等13个相关领域的学术论文。

6、BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS (BBRC)：最新IF=2.985，大家熟悉的研究生之友。

1.1 投稿范围细胞生物学及其相关领域的国内外最新研究科研成果。中国及地方细胞生物学学会的各种会讯和活动消息。1.2 栏目设置设有特约综述、专题介绍、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、教学研究、干细胞研究、探索·发现、新星汇、热点评析、学会动态等栏目，并可根据实际需求开辟新的栏目。1.3 栏目要求专题与综述：深入评介细胞生物学及相关学科某一领域研究的新进展。要求选题重要新颖、评述精辟、注重时效性和前瞻性，论文要求配1幅以上图表。尤其欢迎以本实验室研究工作为基础的高水平综述与专论。研究论文：具有重要学术价值、数据完善和创新性的原始研究工作报告。研究简报：具有首报意义、为争取时间以简报形式发表的阶段性原始研究工作报告。技术与方法：针对细胞生物学领域某一研究方法或某项实验技术的有创新性的、实用性的改进报道。教学研究：针对细胞生物学及相关科学领域的创新性教学方法研究成果的交流。探索·发现：对某一领域探索性研究最新发现的阶段性报道。新星汇：为新创建实验室的年轻科学家提供介绍、交流工作的平台。1.4 文字要求可用中文撰写，附较为详细的英文摘要；也可用英文撰写，附中文摘要。无论用何种语言撰写，均要求写作条理清晰，文字简练流畅。1.5 封面论文在封面上选登当期发表论文中的图片。图片一经选用，该论文即被作为封面论文。封面论文要求是文中能提供1张以上制作精良的彩色图片。凡愿意成为封面论文的作者，请在投稿时声明。 科学名词和术语以全国自然科学名词审定委员会公布的为准。除了国际上通用的缩写词，在摘要和正文中首次出现的缩写词，应先写出中文名词，再在括号内写出英文或拉丁文全称和缩写词。限制性内切酶的前3个英文字母用斜体表示。计量单位和符号按国家技术监督局出版的《量和单位》中规定和国际上通用规则的书写，如：(1) 溶液浓度不用M和N，而用mol/L表示。(2) rpm改为r/min，OD改为A。(3) 相对分子量（Mr）用kDa表示。(4) 秒、分钟和小时分别用s，min和h表示。(5) 统计符号均用斜体：概率用大写斜体P； F 检验用大写斜体F；t检验用小写斜体；样本数用英文小写斜体n ；相关系数用英文小写斜体r ；卡方检验用希文小写χ2；自由度用希文小写斜体υ。稿件由文章题目及各级标题、作者姓名、单位、中英文摘要、关键词、正文、图表、参考文献等部分构成。对各部分的要求分别如下：3.1 文章题目 应言简意赅，不使用不规范的别名或缩写，一般不超过20个字。3.2 各级标题应简短醒目、层次分明，标题不超过三级，字数以不超过15个字为宜。标题编号方式参照以下示例：1 材料与方法1.1 材料1.1.1 质粒、菌种和细胞株3.3 作者姓名和单位 署名人及单位应是对文章全部或部分内容作出主要贡献并能对文章内容负责的人和单位。多作者署名的文章应用“﹡”注明通讯作者。作者姓名与单位应有中英文对照，分别排在中英文题目之下。中国作者姓名英文写法规定为：先写名，后写姓；姓和单、双名首字母大写，双名在两个汉字的拼音字母之间加连字符“-”。例如：“郭礼和”应写作“Li-He Guo”。 单位应写标准全称、所在城市及邮政编码，单位的英文项中还应写明国别。3.4 中英文摘要 应中英文对照，分别排在中英文题目和作者、单位项之下。 摘要应写成报道性文摘，无缩略语和特殊术语。非综述类论文应在摘要中简要地介绍研究目的、方法、结果（主要数据）和结论。中文摘要字数应不超过300个字。中文论文应给出较中文摘要更为详细的英文摘要，英文摘要不超过250个单词。3.5 关键词 不少于3个，不多于8个，中英文对应，分别列在中英文摘要后面。3.6 脚注 脚注应中英文对应，分别排在正文第一页右下方和英文摘要（英文论文为中文摘要）下方，以横线与正文分开。脚注的内容应包括：(1) 收稿日期与接受日期（由本刊编辑部填写）；(2) 经费（基金）资助来源；(3) 通讯作者及其电话、传真、电子信箱（E-mail）；(4) 其他。3.7 正文（1）引言 应包括该研究的目的和该研究与其他相关研究的关系。（2）实验方法 应尽量简短，但应让其他有经验的研究者能够重复该实验。完全新的方法应该详细描述，以前发表过的引用参考文献即可。有关方法的改进只有在必须重复该实验的前提下才需给出详细的论述。（3）结果 应尽量用图表表示，在结果中应避免大量的讨论。（4）讨论 要简明，应集中对所得的结果做出解释而不是重复的叙述。3.8 插图 出现在正文中应该出现的地方，对图像的要求是尽量使用TIFF格式。图必须是高质量的，图像的分辨率必须在350像素(dpi)以上。对只有彩图才能清晰地说明实验结果的，印刷时必须彩印。图应有简明的图题和详尽的图注，以使其容易被读者理解。插图的尺寸要适中，较小图的宽度不超过8 cm，较大图的宽度不超过16 cm。在有分图时，所有数字、字母和符号必须一致，并使用（A）（B）（C）（D）…表示。横、纵坐标必须清楚地标明测量单位。曲线图可按以下顺序：●，○，▲，△，■，□等使用标准的符号。图用中、英文对照表达（图范例）。3.9 表格 使用三线表（不用竖线），直接放在文中适当的位置。 表应有表题并有足够的信息使读者不去查阅正文即可理解该表的内容。表内每一栏均应有表头，表内的缩写应在标注中说明。表题写在表格上方，表注写在表格下方。表用中、英文对照表达（表范例）。3.10 参考文献 采用“顺序编码制”的著录方法，即以文中出现顺序排序而不是以作者和年份排序，作者应对引用的参考文献的正确性负全责。待发表的论文、未正式公开发表的论文（包括私人通讯、毕业论文等）、会议论文摘要等不能作为文献引用。必须引用时，请在正文中括注。以电子版和印刷版同时发表的文献，在著录时以印刷版为准。使用EndNote软件的作者，请在EndNote软件中采用Acta Pharmacol Sin的式样对参考文献进行编辑书写，即可基本符合本刊的参考文献格式要求。 参考文献的作者不超过6人（含6人）全部列出，多于6人时只写前6人，后加“等”或“et al”。姓名采用姓前名后的形式，作者之间不加“和”或“and”。 引用期刊的格式为：文献序数，作者姓名，论文题名，期刊名称（英文标准缩写参考Medline或CA），年份，卷号(期号)，起止页码。例如：1 黄霈, 于超,刘洪涛, 杨竹, 丁裕斌, 王应雄,等。土贝母皂苷甲作用线粒体途径促进人绒毛膜癌Bewo细胞凋亡。中国细胞生物学学报2009; 31(6): 831-6.2 Wei Y, Weng D, Li F, Zou X, Young DO, Ji J, et al. Involvement of JNK regulation in oxidative stress-mediated murine liver injury by microcystin-LR. Apoptosis 2008; 13(8): 1031-42.引用书籍的格式为：文献序数，主编姓名，书名，版本（第1版不著录），出版地，出版社，年份，起止页码。例如：3 翟中和, 王喜忠, 丁明孝。细胞生物学, 第3版。北京: 高等教育出版社, 2007, 101-11.4 Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular Cloning: A laboratory Manual, 2nd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, 88-108.5 Phillips SJ, Whisnant JP. Hypertension and stroke. In: Laragh JH, Brenner BM, eds. Hypertension: Pathophysiology, Diagnosis, and Management, 2nd ed. New York: Raven Press, 1995, 465-78.另外，结合以往作者的投稿情况，以下几点请广大投稿人特别注意：(1) 请不要引用读者很难查阅的文献，如某某大学的博士生毕业论文、某某会议的论文集等。(2) 图题(表题)、图注(表注)、图(表)中的文字和内容一律用英文表达；(3) 综述文章要求书写流利，减少翻译痕迹；引用的文献要新，应有最近1~2年的文献；尽量图文并茂，增加可读性。引用他人图表要给出文献出处，不能原版照抄（获得原文作者以及出版社同意除外），而是要做适当修饰，加入作者自己东西，这样不会侵犯他人知识产权，最好是“根据文献[1]做适当修改”这样的表达。(4) 名词问题：有中文译名的一律用中文表达。请尽可能使用已统一定名的专业名词；请使用已公开发行的有关专业《词汇》中的名词译名；对尚未统一的和不常见的名词，一定要在其后附上英文名词；尚无译名或难以定名的，请直接用英文原名；除了国际上通用的缩写词，在摘要和正文中首次出现的缩写词，应先写出中文名词，再在括号内写出英文或拉丁文全称和缩写词。(5) 很多蛋白质是以其基因命名的，因此，在书写时，应特别小心，稍有疏忽，将正体变成斜体，于是蛋白质变成了基因，反之亦然。

线粒体相关期刊投稿要求

1 出版时间1.1 一般情况下，2个月内即可通知作者稿件是否被录用。评审通过的稿件3～10个月内（自稿件收到之日算起）刊出。2 投稿要求2.1 来稿应具先进性、新颖性和科学性，要求资料真实、数据可靠、论点明确、结构 严谨，文字通顺、精炼，标点符号准确。2.2 述评、综述、进展、论著（包括摘要、图表及参考文献）一般不超过4000字，简报、论著摘要、病例报告等以800～1500字为宜。2.3 来稿须附第一作者主管单位正式介绍信，作者单位应对稿件内容的真实性和保密性负责，确认无署名纠纷、无一稿两投或多投。获得基金资助的论文需注明基金中英文名称及编号。2.4 文稿应隔行打印，一式两份并注意大小写、正斜体及上下角标注等。2.5 请为本刊推荐2～4名可以评审所投稿件的审稿专家，并注明联系方式。2.6 接到回执后2个月未收到任何处理意见，说明稿件仍在审理当中；欲另投他刊请务必与本部联系，切忌一稿两投。2.7 根据著作权法，来稿一律文责自负，本刊对稿件有删改权，凡涉及原意的修改将征得作者同意。修改稿逾3个月不返回本部者视自动退稿。2.8 稿件决定刊用后根据所占版面收取版面费，刊出后酌致稿酬，论著类文稿另赠当期学报1本及单行本25份。来稿请自留底稿，不拟刊用的稿件将退还作者。2.9 稿件接受后，所有作者须签署“著作权专有许可使用授权书”。中国医学科学院 中国协和医科大学对授权文章具有汇编权（文章的部分或全部）、印刷版和电子版的复制权、翻译权、网络传播权、发行权及许可文献检索系统或数据库收录权。3 撰稿要求3.1 题名（篇名） 题名应选用恰当、简洁的短语反映论文的中心内容，除公知公用者外，尽量不用外文缩略语。中文题名一般不宜超过20个汉字，英文题名不宜超过10个实词。中、英文题名含义应一致。尽量不设副题名。3.2 署名 署名作者只限于参与研究课题设计、直接参加全部或主要部分研究工作、做出主要贡献、参加论文撰写并能对内容负责，同时对论文具有答辩能力的人员。如有外籍作者，应附其本人同意发表的书面材料。注明通信作者（用#标注），并在篇首页脚注注明其电话号码、传真号码及E-mail地址。外单位作者应标明其工作单位全称及科室名称及城市名。第一作者单位包括工作单位全称及科室名称、城市名及邮政编码。英文摘要中的作者单位著录项目应与中文一致，并应在邮政编码后加注国名“China”。3.3 摘要 论著、述评及综述应附中英文摘要。论著采用结构式摘要，即按照目的（Objective）、方法（Methods）、结果（Results）、结论（Conclusions）4部分撰写。内容应具独立性和自明性，具有与正文同等量的主要信息。结果部分要求有具体数据、统计学显著性检验的确切值，可信区间等实质内容。中文摘要不超过300个汉字，英文摘要可详细些。述评和综述采用报道性摘要。英文摘要置于中文摘要下方。3.4 关键词 根据论文所讨论的重点内容标出3～8个关键词, 中、英文关键词应一致。3.5 中图号 按照《中国图书资料分类法》（科学技术文献出版社）标引论文分类号。作者可根据论文所涉及的学科范畴标引1～3个分类号。3.6 脚注 在篇首页用短横线与正文分开，说明：3.61 论文所受资助的课题基金来源（中英文）及编号；3.62 合作者的单位、城市名与邮政编码（英文）；3.63 通信作者及其电话、传真号码和E-mail地址（英文）。3.7 正文3.71 格式和层次结构：论著、研究报告可按照前言、材料和方法、结果、讨论4部分撰写。 各层次标题应简短明确，同一级标题应反映同一层次的内容。3.72 前言：简要介绍立题的目的、历史背景或理论依据、研究设想、意义。仅需提供与研究 主题紧密相关的参考文献，切忌写成文献综述。不要涉及本研究中的数据或结论。一般不宜超过250个汉字。3.73 材料和方法：扼要叙述研究对象的特征，主要实验材料的来源、性质及数量，仪器设备 （包括厂家、型号）等实验条件。采用他人方法，引用文献即可；详述创新的方法及改良方 法的改进之处。要求所有方法均可重复验证。说明统计学方法、选择依据及所使用的统计学软件的版本。涉及患者隐私权的临床研究，需征得患者本人或其亲属知情同意，必要时需 通过有关伦理道德委员会审批。3.74 结果：应客观、真实、准确地描述研究所得到的数据和所观察的现象。所有数据均需经 统计学处理。可用文字、图和表表达，但三者不应重复。不展开论证，不引证他人资料。3.75 讨论：围绕研究结果着重阐述研究结果的意义，实事求是地评价其科学价值并可与前人 的有关结果进行比较论证，探讨尚无定论之处。客观真实地解释研究中出现的问题，总结经 验教训。切忌偏离研究结果地罗列资料或重述研究结果。3.8图表 凡可用文字说明者，均不用图表。图、表应具有自明性。每个图表均应有图表题，图表题采用中、英文两种文字，图表内文字、说明及注释仅用英文。图表序号一律用阿拉伯数字表示，只有一个图或一个表时，应标注为“图1”或“表1”。3.81图：图不宜过大，双栏不超过7.5 cm，通栏不超过15.5 cm。图、图题及说明应另纸绘 制和书写，图中文字、字母、数字和符号应清晰、匀整，大小以缩图后清晰易辨为宜。黑白 照片必须反差鲜明，大体照片应有图内标记尺度，显微照片须注明染色方法和放大倍数。3.82 表：表一律采用“三线表”，取消表中竖线。表内参数单位相同者，将单位置于表的右 上方；各栏参数单位不同者，可将单位放于各相应栏目的表头或数值旁。3.9医药学名词 以全国科学技术名词审定委员会公布的各学科名词（科学出版社，1995年）为准。暂无通用译名的名词术语第一次出现时应注明原词或注释，药名（包括中药）以《中华人民共和国药典》最新版本和中国药典委员会编写的《中国药品通用名称》为准，中草药一律加注学名。中文药物名称须使用其通用名称，不得使用商品名。动植物学名应加注标准学名。以上须排斜体字者，在字下加划一条横线。3.10缩略语 题名一般不用缩略语，正文及摘要中的缩略语，应于首次出现处写出全称并加括号。3.11 简化字及标点符号 简化字按照国务院1986年10月15日公布的《简化字总表》规定书写，通常可参照《新华字典》。标点符号以国家标准GB/T15834-1995《标点符号用法》为准。除半字线连字号、长横连字号分别占半格、一格，破折号、省略号不得断开占两格外，每个标点符号占一格。点号和标号的后一半不应出现在一行之首，标号的前一半不应出现在一行之末。3.12 计量单位 按照国务院1984年2月颁布的《中华人民共和国法定计量单位》和2001年中华医学杂志社编写的《法定计量单位在医学上的应用》第3版（人民军医出版社），贯彻国家标准GB 3100～3102-1993《量和单位的规定》，正确使用、书写量和单位的名称和符号，如浓度单位用mo1/L，不再用M；放射性活度单位要换算成Bq，不用Ci等。不再使用分子量dalton和kd，而用相对分子质量Mr。单位符号中表示相除的斜线不得多于一条，也不可混用斜线和负指数幂。不能错把英文缩写cpm、ppb、pphm、ppm、ppt、rpm等作为计量单位使用。血压单位仍使用mm Hg，但在文中第一次出现时应注明与kPa（千帕斯卡）的换算系数。3.13 统计学符号 按国家标准GB3358-1982《统计学名词及符号》的规定书写。统计学符号一般用斜体，但有大小写之分, 如t检验、n（样本大小）、x（样本的算术平均数）、s（标准差）、sx（标准误）、r（相关系数）、x±s（均数士标准差）、x±sx（均数士标准误）等用英文小写，F检验、P值、Q值、M（中位数）等用英文大写，卡方检验和自由度分别用希腊文χ2和υ表示。3.14 数字 凡可使用阿拉伯数字且得体的地方均应使用阿拉伯数字。其使用规则如下：3.141 计量和计数单位前的数字必须使用阿拉伯数字；3.142 多位数字不能拆开转行；3.143 小数点前后4位或多于4位，应分别向左或右每3位空1/4字距，不再用千分撇；3.144 尾数“0”多的5位以上数字，可写为以万和亿为单位的数。3.15 时间：公历世纪、年代、年、月、日、时间和时刻必须用阿拉伯数字。年份用四位数 表示，不能简写，如1997年不能写成97年；日期可采用全数字式写法，如19990228或1999 -02-18或19990218；时刻按GB/T 7408-94规定的写法，如18时20分15秒，写成18:20:15。3.16 数值的修约：不能简单地采用“四舍五入”，应执行国家标准GB 3101-93附录B的 规定，其简明口诀是“4舍6入5看齐，5后有数进上去，尾数为零向左看，左数奇进偶舍 弃”。3.17 参数与偏差范围：3.171 数值范围：5至10写为5～10；5万至10万写为5万～10万， 不能写成5～10万；3.172 百分数范围：要用20%～30%，不能写成20～30%；百分率偏差 应写成（80士5）%，不能写成80%士5%或80士5%；百分数系列不可省略，如60%、 70%、80%不能写成60、70、80%；3.173 有相同单位的量值范围：1.5～2.5mA不必写成 1.5mA～2.5mA；3.174 偏差范围：（30.5士6.2）岁，不能写成30.5士6.2岁。3.18 系列数值的单位：系列数值的单位相同时，中间数字的单位可省略, 如10、15、20 m1。3.19 附带长度单位的数值：每个数值后的单位不能省略, 如50mm×80mm×100mm，不能 写成50×80×100mm3。分数：分数的分号用斜线表示，如2/3，数学公式例外。3.20 检验结果构成比：统一用小数表示，不用百分数，如白细胞分类中的中性粒细胞占75 %，应写成0.75。3.21 志谢 用括号置于正文后，参考文献前。对参加过部分工作的人员、承担实验工作的人员、提供工作方便的人员，以及给予指导、提供资助的个人团体表示感谢。文字力求简练，评价得当，原则上应征得志谢对象的同意。3.22 参考文献 采用顺序编码制，按照引文先后顺序，用阿拉伯数字连续编号。在正文引出处加方括号标注在句尾右上角，或标注在引文作者的右上角。论著的参考文献仅限作者亲自阅读过的主要文献，近5年的文献应占50%。内部资料、鉴定资料、个人通信、报纸、待发表及未公开发表的文章不得作为参考文献引用。文摘、综述等二、三次文献尽量不引用。作者须仔细核对所引参考文献以保证各项内容准确无误。本刊参考文献著录格式如下：3.221 [期刊]作者（3名及3名以内全部著录；多于3名者仅著录前3名，后加“等”或“et al）．文献题名. 刊名，年，卷（期）：起止页.例：陈杰，谢永强，张宏图，等. SARS尸检的肺部病理改变．中国医学科学院学报，2003,25(3) :360-362.例：Peiris JS, Lai ST, Poon LL, et a1．Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome. Lancet, 2003,361(9366):1319-1325.3.222 [书籍] 作者. 书籍名. 版本（第一版可省略）. 出版地：出版者，出版年.起止页.例：吴冠云，方福德. 基因诊断技术及应用. 北京：北京医科大学 中国协和医科大学联合出版社,1992.155-167.例：Willis R. Patho1ogy of tumors. 4th ed. London：Batterrworths,1967.422-432. 「书籍中析出文献」作者. 题名. 见：作（编）者. 书籍名. 版本（第一版可省略）. 出版地：出版者，出版年. 起止页. 例：郭俊渊. 胆道系统、肝脏、胰腺. 见：吴恩惠主编. 放射诊断学. 第2版. 北京：人民卫生出版社，1992.175-191.例：Stoff JS, Clive DM. Role of arachidonic acid metabolites in acute renal failure. In： Brenner BM, Lazarus JM, eds. Acute renal failure. 2nd ed. New York：Churchill Livingstone, 1988.222-251.

审核比较快的期刊，这个其实没有多快的，都是比较慢的，都是在3-4个月左右，慢的有的得5-6个月，也是有的。快的可能是2个月吧。这个也没有一个期刊名单说哪个期刊审核比较快，不是说二区三区的就审核慢，四区的就审核快，不一定的，不同的刊物不一样的。如果你着急发表，去淘淘论文网上看下，那边有一些可以相对快一点发表，也只是相对快而已。

1.1 投稿范围细胞生物学及其相关领域的国内外最新研究科研成果。中国及地方细胞生物学学会的各种会讯和活动消息。1.2 栏目设置设有特约综述、专题介绍、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、教学研究、干细胞研究、探索·发现、新星汇、热点评析、学会动态等栏目，并可根据实际需求开辟新的栏目。1.3 栏目要求专题与综述：深入评介细胞生物学及相关学科某一领域研究的新进展。要求选题重要新颖、评述精辟、注重时效性和前瞻性，论文要求配1幅以上图表。尤其欢迎以本实验室研究工作为基础的高水平综述与专论。研究论文：具有重要学术价值、数据完善和创新性的原始研究工作报告。研究简报：具有首报意义、为争取时间以简报形式发表的阶段性原始研究工作报告。技术与方法：针对细胞生物学领域某一研究方法或某项实验技术的有创新性的、实用性的改进报道。教学研究：针对细胞生物学及相关科学领域的创新性教学方法研究成果的交流。探索·发现：对某一领域探索性研究最新发现的阶段性报道。新星汇：为新创建实验室的年轻科学家提供介绍、交流工作的平台。1.4 文字要求可用中文撰写，附较为详细的英文摘要；也可用英文撰写，附中文摘要。无论用何种语言撰写，均要求写作条理清晰，文字简练流畅。1.5 封面论文在封面上选登当期发表论文中的图片。图片一经选用，该论文即被作为封面论文。封面论文要求是文中能提供1张以上制作精良的彩色图片。凡愿意成为封面论文的作者，请在投稿时声明。 科学名词和术语以全国自然科学名词审定委员会公布的为准。除了国际上通用的缩写词，在摘要和正文中首次出现的缩写词，应先写出中文名词，再在括号内写出英文或拉丁文全称和缩写词。限制性内切酶的前3个英文字母用斜体表示。计量单位和符号按国家技术监督局出版的《量和单位》中规定和国际上通用规则的书写，如：(1) 溶液浓度不用M和N，而用mol/L表示。(2) rpm改为r/min，OD改为A。(3) 相对分子量（Mr）用kDa表示。(4) 秒、分钟和小时分别用s，min和h表示。(5) 统计符号均用斜体：概率用大写斜体P； F 检验用大写斜体F；t检验用小写斜体；样本数用英文小写斜体n ；相关系数用英文小写斜体r ；卡方检验用希文小写χ2；自由度用希文小写斜体υ。稿件由文章题目及各级标题、作者姓名、单位、中英文摘要、关键词、正文、图表、参考文献等部分构成。对各部分的要求分别如下：3.1 文章题目 应言简意赅，不使用不规范的别名或缩写，一般不超过20个字。3.2 各级标题应简短醒目、层次分明，标题不超过三级，字数以不超过15个字为宜。标题编号方式参照以下示例：1 材料与方法1.1 材料1.1.1 质粒、菌种和细胞株3.3 作者姓名和单位 署名人及单位应是对文章全部或部分内容作出主要贡献并能对文章内容负责的人和单位。多作者署名的文章应用“﹡”注明通讯作者。作者姓名与单位应有中英文对照，分别排在中英文题目之下。中国作者姓名英文写法规定为：先写名，后写姓；姓和单、双名首字母大写，双名在两个汉字的拼音字母之间加连字符“-”。例如：“郭礼和”应写作“Li-He Guo”。 单位应写标准全称、所在城市及邮政编码，单位的英文项中还应写明国别。3.4 中英文摘要 应中英文对照，分别排在中英文题目和作者、单位项之下。 摘要应写成报道性文摘，无缩略语和特殊术语。非综述类论文应在摘要中简要地介绍研究目的、方法、结果（主要数据）和结论。中文摘要字数应不超过300个字。中文论文应给出较中文摘要更为详细的英文摘要，英文摘要不超过250个单词。3.5 关键词 不少于3个，不多于8个，中英文对应，分别列在中英文摘要后面。3.6 脚注 脚注应中英文对应，分别排在正文第一页右下方和英文摘要（英文论文为中文摘要）下方，以横线与正文分开。脚注的内容应包括：(1) 收稿日期与接受日期（由本刊编辑部填写）；(2) 经费（基金）资助来源；(3) 通讯作者及其电话、传真、电子信箱（E-mail）；(4) 其他。3.7 正文（1）引言 应包括该研究的目的和该研究与其他相关研究的关系。（2）实验方法 应尽量简短，但应让其他有经验的研究者能够重复该实验。完全新的方法应该详细描述，以前发表过的引用参考文献即可。有关方法的改进只有在必须重复该实验的前提下才需给出详细的论述。（3）结果 应尽量用图表表示，在结果中应避免大量的讨论。（4）讨论 要简明，应集中对所得的结果做出解释而不是重复的叙述。3.8 插图 出现在正文中应该出现的地方，对图像的要求是尽量使用TIFF格式。图必须是高质量的，图像的分辨率必须在350像素(dpi)以上。对只有彩图才能清晰地说明实验结果的，印刷时必须彩印。图应有简明的图题和详尽的图注，以使其容易被读者理解。插图的尺寸要适中，较小图的宽度不超过8 cm，较大图的宽度不超过16 cm。在有分图时，所有数字、字母和符号必须一致，并使用（A）（B）（C）（D）…表示。横、纵坐标必须清楚地标明测量单位。曲线图可按以下顺序：●，○，▲，△，■，□等使用标准的符号。图用中、英文对照表达（图范例）。3.9 表格 使用三线表（不用竖线），直接放在文中适当的位置。 表应有表题并有足够的信息使读者不去查阅正文即可理解该表的内容。表内每一栏均应有表头，表内的缩写应在标注中说明。表题写在表格上方，表注写在表格下方。表用中、英文对照表达（表范例）。3.10 参考文献 采用“顺序编码制”的著录方法，即以文中出现顺序排序而不是以作者和年份排序，作者应对引用的参考文献的正确性负全责。待发表的论文、未正式公开发表的论文（包括私人通讯、毕业论文等）、会议论文摘要等不能作为文献引用。必须引用时，请在正文中括注。以电子版和印刷版同时发表的文献，在著录时以印刷版为准。使用EndNote软件的作者，请在EndNote软件中采用Acta Pharmacol Sin的式样对参考文献进行编辑书写，即可基本符合本刊的参考文献格式要求。 参考文献的作者不超过6人（含6人）全部列出，多于6人时只写前6人，后加“等”或“et al”。姓名采用姓前名后的形式，作者之间不加“和”或“and”。 引用期刊的格式为：文献序数，作者姓名，论文题名，期刊名称（英文标准缩写参考Medline或CA），年份，卷号(期号)，起止页码。例如：1 黄霈, 于超,刘洪涛, 杨竹, 丁裕斌, 王应雄,等。土贝母皂苷甲作用线粒体途径促进人绒毛膜癌Bewo细胞凋亡。中国细胞生物学学报2009; 31(6): 831-6.2 Wei Y, Weng D, Li F, Zou X, Young DO, Ji J, et al. Involvement of JNK regulation in oxidative stress-mediated murine liver injury by microcystin-LR. Apoptosis 2008; 13(8): 1031-42.引用书籍的格式为：文献序数，主编姓名，书名，版本（第1版不著录），出版地，出版社，年份，起止页码。例如：3 翟中和, 王喜忠, 丁明孝。细胞生物学, 第3版。北京: 高等教育出版社, 2007, 101-11.4 Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular Cloning: A laboratory Manual, 2nd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, 88-108.5 Phillips SJ, Whisnant JP. Hypertension and stroke. In: Laragh JH, Brenner BM, eds. Hypertension: Pathophysiology, Diagnosis, and Management, 2nd ed. New York: Raven Press, 1995, 465-78.另外，结合以往作者的投稿情况，以下几点请广大投稿人特别注意：(1) 请不要引用读者很难查阅的文献，如某某大学的博士生毕业论文、某某会议的论文集等。(2) 图题(表题)、图注(表注)、图(表)中的文字和内容一律用英文表达；(3) 综述文章要求书写流利，减少翻译痕迹；引用的文献要新，应有最近1~2年的文献；尽量图文并茂，增加可读性。引用他人图表要给出文献出处，不能原版照抄（获得原文作者以及出版社同意除外），而是要做适当修饰，加入作者自己东西，这样不会侵犯他人知识产权，最好是“根据文献[1]做适当修改”这样的表达。(4) 名词问题：有中文译名的一律用中文表达。请尽可能使用已统一定名的专业名词；请使用已公开发行的有关专业《词汇》中的名词译名；对尚未统一的和不常见的名词，一定要在其后附上英文名词；尚无译名或难以定名的，请直接用英文原名；除了国际上通用的缩写词，在摘要和正文中首次出现的缩写词，应先写出中文名词，再在括号内写出英文或拉丁文全称和缩写词。(5) 很多蛋白质是以其基因命名的，因此，在书写时，应特别小心，稍有疏忽，将正体变成斜体，于是蛋白质变成了基因，反之亦然。

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1 出版时间1.1 一般情况下，2个月内即可通知作者稿件是否被录用。评审通过的稿件3～10个月内（自稿件收到之日算起）刊出。2 投稿要求2.1 来稿应具先进性、新颖性和科学性，要求资料真实、数据可靠、论点明确、结构 严谨，文字通顺、精炼，标点符号准确。2.2 述评、综述、进展、论著（包括摘要、图表及参考文献）一般不超过4000字，简报、论著摘要、病例报告等以800～1500字为宜。2.3 来稿须附第一作者主管单位正式介绍信，作者单位应对稿件内容的真实性和保密性负责，确认无署名纠纷、无一稿两投或多投。获得基金资助的论文需注明基金中英文名称及编号。2.4 文稿应隔行打印，一式两份并注意大小写、正斜体及上下角标注等。2.5 请为本刊推荐2～4名可以评审所投稿件的审稿专家，并注明联系方式。2.6 接到回执后2个月未收到任何处理意见，说明稿件仍在审理当中；欲另投他刊请务必与本部联系，切忌一稿两投。2.7 根据著作权法，来稿一律文责自负，本刊对稿件有删改权，凡涉及原意的修改将征得作者同意。修改稿逾3个月不返回本部者视自动退稿。2.8 稿件决定刊用后根据所占版面收取版面费，刊出后酌致稿酬，论著类文稿另赠当期学报1本及单行本25份。来稿请自留底稿，不拟刊用的稿件将退还作者。2.9 稿件接受后，所有作者须签署“著作权专有许可使用授权书”。中国医学科学院 中国协和医科大学对授权文章具有汇编权（文章的部分或全部）、印刷版和电子版的复制权、翻译权、网络传播权、发行权及许可文献检索系统或数据库收录权。3 撰稿要求3.1 题名（篇名） 题名应选用恰当、简洁的短语反映论文的中心内容，除公知公用者外，尽量不用外文缩略语。中文题名一般不宜超过20个汉字，英文题名不宜超过10个实词。中、英文题名含义应一致。尽量不设副题名。3.2 署名 署名作者只限于参与研究课题设计、直接参加全部或主要部分研究工作、做出主要贡献、参加论文撰写并能对内容负责，同时对论文具有答辩能力的人员。如有外籍作者，应附其本人同意发表的书面材料。注明通信作者（用#标注），并在篇首页脚注注明其电话号码、传真号码及E-mail地址。外单位作者应标明其工作单位全称及科室名称及城市名。第一作者单位包括工作单位全称及科室名称、城市名及邮政编码。英文摘要中的作者单位著录项目应与中文一致，并应在邮政编码后加注国名“China”。3.3 摘要 论著、述评及综述应附中英文摘要。论著采用结构式摘要，即按照目的（Objective）、方法（Methods）、结果（Results）、结论（Conclusions）4部分撰写。内容应具独立性和自明性，具有与正文同等量的主要信息。结果部分要求有具体数据、统计学显著性检验的确切值，可信区间等实质内容。中文摘要不超过300个汉字，英文摘要可详细些。述评和综述采用报道性摘要。英文摘要置于中文摘要下方。3.4 关键词 根据论文所讨论的重点内容标出3～8个关键词, 中、英文关键词应一致。3.5 中图号 按照《中国图书资料分类法》（科学技术文献出版社）标引论文分类号。作者可根据论文所涉及的学科范畴标引1～3个分类号。3.6 脚注 在篇首页用短横线与正文分开，说明：3.61 论文所受资助的课题基金来源（中英文）及编号；3.62 合作者的单位、城市名与邮政编码（英文）；3.63 通信作者及其电话、传真号码和E-mail地址（英文）。3.7 正文3.71 格式和层次结构：论著、研究报告可按照前言、材料和方法、结果、讨论4部分撰写。 各层次标题应简短明确，同一级标题应反映同一层次的内容。3.72 前言：简要介绍立题的目的、历史背景或理论依据、研究设想、意义。仅需提供与研究 主题紧密相关的参考文献，切忌写成文献综述。不要涉及本研究中的数据或结论。一般不宜超过250个汉字。3.73 材料和方法：扼要叙述研究对象的特征，主要实验材料的来源、性质及数量，仪器设备 （包括厂家、型号）等实验条件。采用他人方法，引用文献即可；详述创新的方法及改良方 法的改进之处。要求所有方法均可重复验证。说明统计学方法、选择依据及所使用的统计学软件的版本。涉及患者隐私权的临床研究，需征得患者本人或其亲属知情同意，必要时需 通过有关伦理道德委员会审批。3.74 结果：应客观、真实、准确地描述研究所得到的数据和所观察的现象。所有数据均需经 统计学处理。可用文字、图和表表达，但三者不应重复。不展开论证，不引证他人资料。3.75 讨论：围绕研究结果着重阐述研究结果的意义，实事求是地评价其科学价值并可与前人 的有关结果进行比较论证，探讨尚无定论之处。客观真实地解释研究中出现的问题，总结经 验教训。切忌偏离研究结果地罗列资料或重述研究结果。3.8图表 凡可用文字说明者，均不用图表。图、表应具有自明性。每个图表均应有图表题，图表题采用中、英文两种文字，图表内文字、说明及注释仅用英文。图表序号一律用阿拉伯数字表示，只有一个图或一个表时，应标注为“图1”或“表1”。3.81图：图不宜过大，双栏不超过7.5 cm，通栏不超过15.5 cm。图、图题及说明应另纸绘 制和书写，图中文字、字母、数字和符号应清晰、匀整，大小以缩图后清晰易辨为宜。黑白 照片必须反差鲜明，大体照片应有图内标记尺度，显微照片须注明染色方法和放大倍数。3.82 表：表一律采用“三线表”，取消表中竖线。表内参数单位相同者，将单位置于表的右 上方；各栏参数单位不同者，可将单位放于各相应栏目的表头或数值旁。3.9医药学名词 以全国科学技术名词审定委员会公布的各学科名词（科学出版社，1995年）为准。暂无通用译名的名词术语第一次出现时应注明原词或注释，药名（包括中药）以《中华人民共和国药典》最新版本和中国药典委员会编写的《中国药品通用名称》为准，中草药一律加注学名。中文药物名称须使用其通用名称，不得使用商品名。动植物学名应加注标准学名。以上须排斜体字者，在字下加划一条横线。3.10缩略语 题名一般不用缩略语，正文及摘要中的缩略语，应于首次出现处写出全称并加括号。3.11 简化字及标点符号 简化字按照国务院1986年10月15日公布的《简化字总表》规定书写，通常可参照《新华字典》。标点符号以国家标准GB/T15834-1995《标点符号用法》为准。除半字线连字号、长横连字号分别占半格、一格，破折号、省略号不得断开占两格外，每个标点符号占一格。点号和标号的后一半不应出现在一行之首，标号的前一半不应出现在一行之末。3.12 计量单位 按照国务院1984年2月颁布的《中华人民共和国法定计量单位》和2001年中华医学杂志社编写的《法定计量单位在医学上的应用》第3版（人民军医出版社），贯彻国家标准GB 3100～3102-1993《量和单位的规定》，正确使用、书写量和单位的名称和符号，如浓度单位用mo1/L，不再用M；放射性活度单位要换算成Bq，不用Ci等。不再使用分子量dalton和kd，而用相对分子质量Mr。单位符号中表示相除的斜线不得多于一条，也不可混用斜线和负指数幂。不能错把英文缩写cpm、ppb、pphm、ppm、ppt、rpm等作为计量单位使用。血压单位仍使用mm Hg，但在文中第一次出现时应注明与kPa（千帕斯卡）的换算系数。3.13 统计学符号 按国家标准GB3358-1982《统计学名词及符号》的规定书写。统计学符号一般用斜体，但有大小写之分, 如t检验、n（样本大小）、x（样本的算术平均数）、s（标准差）、sx（标准误）、r（相关系数）、x±s（均数士标准差）、x±sx（均数士标准误）等用英文小写，F检验、P值、Q值、M（中位数）等用英文大写，卡方检验和自由度分别用希腊文χ2和υ表示。3.14 数字 凡可使用阿拉伯数字且得体的地方均应使用阿拉伯数字。其使用规则如下：3.141 计量和计数单位前的数字必须使用阿拉伯数字；3.142 多位数字不能拆开转行；3.143 小数点前后4位或多于4位，应分别向左或右每3位空1/4字距，不再用千分撇；3.144 尾数“0”多的5位以上数字，可写为以万和亿为单位的数。3.15 时间：公历世纪、年代、年、月、日、时间和时刻必须用阿拉伯数字。年份用四位数 表示，不能简写，如1997年不能写成97年；日期可采用全数字式写法，如19990228或1999 -02-18或19990218；时刻按GB/T 7408-94规定的写法，如18时20分15秒，写成18:20:15。3.16 数值的修约：不能简单地采用“四舍五入”，应执行国家标准GB 3101-93附录B的 规定，其简明口诀是“4舍6入5看齐，5后有数进上去，尾数为零向左看，左数奇进偶舍 弃”。3.17 参数与偏差范围：3.171 数值范围：5至10写为5～10；5万至10万写为5万～10万， 不能写成5～10万；3.172 百分数范围：要用20%～30%，不能写成20～30%；百分率偏差 应写成（80士5）%，不能写成80%士5%或80士5%；百分数系列不可省略，如60%、 70%、80%不能写成60、70、80%；3.173 有相同单位的量值范围：1.5～2.5mA不必写成 1.5mA～2.5mA；3.174 偏差范围：（30.5士6.2）岁，不能写成30.5士6.2岁。3.18 系列数值的单位：系列数值的单位相同时，中间数字的单位可省略, 如10、15、20 m1。3.19 附带长度单位的数值：每个数值后的单位不能省略, 如50mm×80mm×100mm，不能 写成50×80×100mm3。分数：分数的分号用斜线表示，如2/3，数学公式例外。3.20 检验结果构成比：统一用小数表示，不用百分数，如白细胞分类中的中性粒细胞占75 %，应写成0.75。3.21 志谢 用括号置于正文后，参考文献前。对参加过部分工作的人员、承担实验工作的人员、提供工作方便的人员，以及给予指导、提供资助的个人团体表示感谢。文字力求简练，评价得当，原则上应征得志谢对象的同意。3.22 参考文献 采用顺序编码制，按照引文先后顺序，用阿拉伯数字连续编号。在正文引出处加方括号标注在句尾右上角，或标注在引文作者的右上角。论著的参考文献仅限作者亲自阅读过的主要文献，近5年的文献应占50%。内部资料、鉴定资料、个人通信、报纸、待发表及未公开发表的文章不得作为参考文献引用。文摘、综述等二、三次文献尽量不引用。作者须仔细核对所引参考文献以保证各项内容准确无误。本刊参考文献著录格式如下：3.221 [期刊]作者（3名及3名以内全部著录；多于3名者仅著录前3名，后加“等”或“et al）．文献题名. 刊名，年，卷（期）：起止页.例：陈杰，谢永强，张宏图，等. SARS尸检的肺部病理改变．中国医学科学院学报，2003,25(3) :360-362.例：Peiris JS, Lai ST, Poon LL, et a1．Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome. Lancet, 2003,361(9366):1319-1325.3.222 [书籍] 作者. 书籍名. 版本（第一版可省略）. 出版地：出版者，出版年.起止页.例：吴冠云，方福德. 基因诊断技术及应用. 北京：北京医科大学 中国协和医科大学联合出版社,1992.155-167.例：Willis R. Patho1ogy of tumors. 4th ed. London：Batterrworths,1967.422-432. 「书籍中析出文献」作者. 题名. 见：作（编）者. 书籍名. 版本（第一版可省略）. 出版地：出版者，出版年. 起止页. 例：郭俊渊. 胆道系统、肝脏、胰腺. 见：吴恩惠主编. 放射诊断学. 第2版. 北京：人民卫生出版社，1992.175-191.例：Stoff JS, Clive DM. Role of arachidonic acid metabolites in acute renal failure. In： Brenner BM, Lazarus JM, eds. Acute renal failure. 2nd ed. New York：Churchill Livingstone, 1988.222-251.

为从分子水平上进一步理解世界范围内山羊母系遗传多样性、基因流变迁、群体结构和群体扩张 历史 。 西南大学 动物科学技术学院俄广鑫教授团队 利用已公布的4165个来自于全世界196个品种的山羊线粒体D_Loop序列，进行核苷酸多样性、单倍型构建、单倍型多样性、群体系统发育学研究、中性检验及群体遗传距离等一系列遗传参数进行评估。在全部个体的401 bp片段长度的D_Loop区域内共鉴定得到301个多态位点，总体核苷酸多样性为0.03471；构建获得并构建2409个D_Loop单倍型，单倍型平均多样性为0.9983。系统发育分析表明，98.92%的单倍型被聚类为已知的6个山羊线粒体D_loop单倍型簇，其中单倍型A所占比例最大(86%)，D_Loop单倍型B簇在中国山羊中出现频率最高。中国西南地区山羊群体中发现了两个未知的D_Loop单倍型簇(Unknown I和Unknown II)。分子方差分析(AMOVA)和群体间成对差异(PiXY)研究结果表明，不同品种家养山羊间群体变异较小，群体遗传分化与地理分布不完全一致，表明群体间广泛存在遗传物质交流。中性检验(Tajima‘D和Fu’Fs检验)和错配分布研究结果表明，单倍型簇B、C和G存在群体扩张 历史 。较其他野羊， Capra aegagrus 与家养山羊系统发育关系最为密切，并可能贡献于山羊A、B、C和F单倍群簇的驯化起源。本研究表明线粒体D_Loop单倍型B簇可能起源于中国或在山羊驯化早期已迁至中国，在中国西南地区山羊群体中两个未知的D_Loop单倍型簇的发现表明中国西南地区可能具有独特的山羊母系背景或驯化 历史 ； Capra aegagrus 是最可能的家养山羊野生祖先，并可能贡献于山羊A、B、C和F单倍群簇的驯化起源。 故而，本研究利用大样本量全世界山羊线粒体D_Loop序列数据集分析有助于更好的理解世界范围内山羊母系驯化起源及基因流动的 历史 变化，为进一步明确世界山羊群体迁徙的演变 历史 及种群系统发育定位提供了宝贵的理论依据。 论文链接： 引用本文 >>> GUO Yi, GONG Ying, HE Yong-meng, YANG Bai-gao, ZHANG Wei-yi, CHEN Bo-er, HUANG Yong-fu, ZHAO Yong-ju, ZHANG Dan-ping, MA Yue-hui, CHU Ming-xing, E Guang-xin. 2022. Investigation of Mitochondrial DNA genetic persity and phylogeny of goats worldwide. Journal of Integrative Agriculture , in press. Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业 科学 院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，主编为中国工程院院士万建民。JIA主要栏目有作物学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、资源环境、食品科学、农业经济与管理等，刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD)平台OA出版。最新SCI影响因子2.848，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区，中科院分区农林类期刊二区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持 。

O4 物理学类核心期刊表 纯粹物理 序号 刊 名 出版周期 出版地 主 办 单 位 ISSN 联系方式 1 物理学报 月刊 北京 中国物理学会 1000-3290 北京 603 信箱（ 100080 ）编辑部电话： 2 光学学报 月刊 上海 中国光学学会 0253-2239 上海 800-211 信箱（ 201800 ）编辑部电话： 3 高能物理与核物理 月刊 北京 中国科学院高能物理研究所 0254-3052 北京市 918 信箱（ 100039 ）编辑部电话： -2664 4 物理 月刊 北京 中国物理学会 0379-4148 北京海淀区中关村中国科学院物理研究所（ 100080 ）编辑部电话： 5 原子与分子物理学报 季刊 成都 中国物理学会原子与分子物理专业委员会 1000-0364 四川大学（西）原子与分子物理研究所 （ 610065 ）编辑部电话： -45234 6 低温物理学报 双月刊 合肥 中国物理学会 1000-3258 合肥市中国科学技术大学（ 230026 ）编辑部电话： 7 半导体学报 月刊 北京 中国电子学会等 0253-4177 北京 912 信箱（ 100083 ）编辑部电话： -277 8 声学学报 双月刊 北京 中国声学学会 0371-0025 北京海淀区中关村路 17 号（ 100080 ）编辑部电话： isx@ 9 波谱学杂志 双月刊 武汉 中国科学院武汉物理研究所等 1000-4556 武汉市 71010 信箱（ 430071 ）编辑部电话： 10 物理学进展 季刊 南京 中国物理学会 1000-0542 南京市南京大学（ 210008 ））编辑部电话： 11 高压物理学报 季刊 成都 四川省物理学会 1000-5773 成都市 523 信箱 60 分箱（ 610003 ）编辑部电话： 12 低温与超导 季刊 合肥 信息产业部合肥低温电子研究所 1001-7100 合肥市 1019 信箱（ 230043 ） 13 大学物理 月刊 北京 中国物理学会 1000-0712 北京师范大学物理系（ 100875 ）编辑部电话： 应用物理 1 人工晶体学报 双月刊 北京 人工晶体研究所等 1000-985X 北京市 733 信箱， 100018 ，电话： 6549332 2 光子学报 月刊 西安 中国光学学会 1004-4213 西安 80 号信箱 47 分箱《光子学报》编辑部， 710068 3 量子电子学报 双月刊 合肥 中国光学学会基础光学专业委员会 1007-5461 合肥 1125 号信箱 ,230031, 电话： 0551-559156 4 发光学报 季刊 长春 中国物理学会发光 分科学 会等 1000-7032 吉林省长春市东南湖大路 16 号 130033 电话： 5 红外与毫米波学报 双月刊 上海 中国光学学会等 1001-9014 上海市中山北一路 420 号 200083 电话： -24502 6 计算物理 双月刊 北京 计算物理学会等 1001-246X 北京市 8009 信箱 100088 电话： -2292 ， 62014411-2647 7 核技术 月刊 上海 中国核学会等 0253-3219 上海市 800-204 信箱 201800 电话： 8 金属学报 月刊 沈阳 中国金属学会等 0412-1961 辽宁省沈阳市文化路 72 号 110016 电话： 9 核聚变与等离子体物理 季刊 成都 核工业西南物理研究所 0254-6086 四川省成都市 432 信箱 610041 电话： 10 无机材料学报 双月刊 上海 中国科学院上海硅酸盐研究所 1000-324X 上海市定西路 1295 号， 200050 ， TEL ： 52411301 5241130 11 材料研究学报 双月刊 沈阳 中国材料研究学会等 1005-3093 辽宁省沈阳市沈河区文化路 72 号 110016 电话： 12 光谱学与光谱分析 双月刊 北京 中国光学学会光谱委员会等 1000-0593 北京市海淀区学院南路 76 号（ 100081 ） 13 强激光与粒子束 双月刊 绵阳 中国工程物理研究所，四川省核学会 1001-4322 四川省绵阳市 919-805 信箱 621900 电话： 14 真空 双月刊 沈阳 机械电子工业部沈阳真空技术研究所 1002-0322 辽宁省沈阳市沈河区万柳塘路 2 号 110042 电话： 15 原子能科学技术 双月刊 北京 中国原子能科学研究院 1000-6931 北京市 275 信箱 65 分箱 102413 电话： 16 中国激光 月刊 上海 中国光学学会，中国科学院上海光学精密机械研究所 0258-7025 上海市 800-211 信箱 201800

线粒体dna投稿期刊

发表期刊：Nature  发表日期：2020.02 影响因子：42.778 癌症是全球第二大常见死因，每年超过800万人因癌症丧命。预计在未来十年，癌症发生率将增加50%以上。癌症是体细胞亚克隆自主发展和扩散类疾病的总称。癌症克隆控制多个细胞通路，打破正常细胞的生长和调控等限制，获取自主发展和扩散的特征。单个细胞通路改变不足以引发癌症。每个癌症由潜在的致病异常“池”中的多个异常通路组合而引发。 肿瘤异质性来自于达尔文进化的随机性。达尔文进化的三个先决条件：（1）群体中的特征是变化的；（2）变异从亲本遗传到子代；（3）群体为了生存进行竞争。一部分突变改变细胞表型，一部分突变使克隆获取逃逸正常生理控制的优势。提供选择优势的突变称为驱动突变，反之称为乘客突变。 选用2834个患者人全基因组测序数据（WGS），去除176个患者低质量数据，共计2658个患者的WGS数据，其中有2583个患者高质量数据。2658个患者共取2605个原发肿瘤和173个转移或复发肿瘤，正常样本平均测序深度为39×，肿瘤测序深度分别为38×和60×。研究群体包括1469男性（55%）和1189女性（45%），平均年龄56岁，覆盖38种肿瘤类型。其中，1222个患者具有RNA-seq数据。 利用以上数据分析somatic SNVs, somatic Indels, somatic CNVs, somatic SVs,体细胞逆转录事件，线粒体DNA突变、端粒长度以及germline SNV, Indel, SVs等事件。 利用3个核心变异检测流程和额外10个变异检测流程，对63对tumor-normal变异检测，估测3个核心流程的敏感度和精确度。并对其中50对进行高深度靶向测序验证。3个核心流程检测到真实变异的敏感度为80~90%，每个流程检测的95%以上变异是真实的somatic mutations。针对Indel检测，3个核心流程的敏感度是40~50%，精确度是70~95%。SV检测算法的精确度在80~95%。 对3个核心流程的变异结果合并，评估合并集合中突变的属性：Somatic SNVs敏感度为95%（90%置信区间，88~98%），精确度为95%（90%置信区间，71~99%）。Somatic Indels 检测敏感度为60%（34~72%）和精确度91%（73~96%）。合并的Somatic SVs 敏感度为90%，精确度为97.5%。多种方法检测变异提高了低频突变检出的准确性。 分析2583个患者数据，共检测到43,778,859个somatic SNVs，410,123个somatic 多核酸突变，2,418,247个somatic Indels，288,416个somatic SVs，19,166 体细胞逆转录事件，8,185个新线粒体突变。通过相关性分析，发现诊断年龄和体细胞突变数量相关：年龄每增长一年，增加约190个SNVs，约22个Indels。 3.1癌症驱动突变全景图 根据突变的性质和已知癌症相关基因，预测肿瘤的驱动基因；利用已知的启动子和增强子分析非编码驱动突变。结果发现，91%的肿瘤至少有1个驱动突变，每个肿瘤平均有4.6个驱动突变（癌种之间变化较大）。对于编码区点突变，每个肿瘤平均有2.6个驱动突变。除此之外， 13%（785/5913）的驱动点突变是非编码突变，而且1/3（237/785）突变发生在 TERT 启动子上；25%肿瘤具有非编码驱动突变。说明：非编码区驱动点突变频率较编码区低；与 TERT 启动子相比，其他启动子和增强子并不常发生驱动突变。 根据肿瘤类型，SVs和点突变致力于不同的癌症发生机制。驱动SVs常发生在乳腺癌和卵巢腺癌；驱动点突变常出现在在结肠腺癌和成熟B细胞淋巴瘤。 文章发现抑癌基因的驱动突变多为二次打击事件。例如，954个肿瘤具有 TP53 突变，736（77%）个肿瘤样本的两个等位基因均发生突变，其中96%（707/736）是等位基因突变和等位基因缺失同时发生。17%的病人在癌症相关基因上具有稀少的胚系蛋白截断体突变，5.4%病人由于somatic mutations导致以上基因次等位基因失活。 3.2没有驱动突变的PCAWG肿瘤数据分析 90%以上的PCAWG样本鉴定到驱动突变，仍有181个样本未检测到驱动突变。分析肿瘤样本未找到驱动突变的原因，有以下几点：（1）样本质量低：4/181个样本的正常对照被肿瘤DNA污染，每个对照含有超过5%的肿瘤DNA；同理，肿瘤样本中肿瘤细胞含量较低也会影响突变检出；（2）驱动突变位点覆盖度较低无法满足突变检出：6个肝细胞癌和2个胆管癌在高深度靶向测序后检测到 TERT 突变；（3）生信分析方法：35个骨髓增生性肿瘤未检测到 JAK2 V617F 突变，由于利用Panels of normals作为对照去除测序影响导致。2~5%的健康人群具有造血克隆，可能涵盖了驱动突变；（4）驱动基因检测力不足，说明某些肿瘤中存在未被发现的基因富集；（5）染色体变异：19/43肾细胞癌和18/81前列腺癌缺少驱动突变，但发生染色体异常，有可能单凭染色体扩增或缺失足以引发癌症。 3.3成簇突变和SVs模式 癌症中，单个灾难性事件可产生多个聚集性突变，导致基因组大量重组。主要包含：（1）染色体重排：不同染色体的DNA双链断裂修复导致重排发生；（2）Kataegis（雷雨）：单链DNA局部超突变，导致聚集性核苷酸替换；（3）染色体碎裂：数十数百个DNA断裂同时发生在一个或者几个染色体，产生的碎片随机组合在一起。 467个样本（17.8%）发生染色体重排和平衡易位，主要发生在前列腺癌、淋巴系统恶性肿瘤和甲状腺癌。重排事件导致甲状腺癌的部分融合基因的产生，例如 RET 、 NTRK3 和 IGF2BP3 等等。 60.5%癌症中发生Kataegis事件，例如肺鳞癌、膀胱癌、肢端黑色素瘤和肉瘤等。Kataegis主要包含（1）由APOBEC活性导致TpC的C>N 突变；（2）聚合酶导致 T pT或Cp T 的T > N突变。81.7%的Kataegis事件与 APOBEC3B 表达水平相关，5.7%与易错聚合酶相关，以及2.3%事件是GpC 或 CpC的胞嘧啶脱氨导致的。Kataegis事件与SV断点相关，尤其是缺失和复杂重排事件，包括在缺失附近10-25kb内Cp T pT的T>N 突变。 Kataegis事件包含4种局部超突变类型：（1）脱靶体细胞超突变和局部Cp T pT的T>N 突变；（2）与复杂重排相关的APOBEC；（3）后随链和早期复制区域的APOBEC；（4）后两种类型混合。 587（22.3%）个染色体碎裂样本，主要为肉瘤、脑胶质瘤、肺鳞癌、黑色素瘤和乳腺癌样本。染色体碎裂伴随全基因组重复，相关的驱动基因为 TP53 。肉瘤和B细胞淋巴瘤患者中，女性发生染色体碎裂的频率高于男性；前列腺患者中，晚期患者具有更高频率的染色体碎裂。染色体碎裂区域包含3.6%驱动基因和7%拷贝数驱动。 3.4进化中时间聚集性突变 根据分子时钟分析每个肿瘤的进化史：主克隆发生在早期，亚克隆突变发生在后期；拷贝数扩增区域，分子时间根据突变发生在拷贝之前或者之后进行划分。染色体碎裂通常发生在主克隆，特别是在脂肪肉瘤、前列腺癌和肺鳞癌说明是癌症进化早期事件。在黑色素瘤中，染色体碎裂扩增涉及到较多的癌症相关基因，例如 CCND1 ,  TERT ,  CDKN2A ,  TP53 和 MYC 。 在扩增的染色体碎裂事件中，利用SNV的拷贝数目计算扩增发生的时间，SNV发生在扩增之前，将会有很高比例的reads携带SNVs。相反，SNV发生在拷贝数变异之后，将只有一条染色体携带SNV，具有较低的变异频率。肢端黑色素瘤的 CCND1 扩增区域具有较少的高频突变，而皮肤黑色素瘤更多突变发生在扩增之前。 3.5胚系突变对somatic mutations的影响 根据检测到的胚系突变分析胚系突变对体细胞突变率和模式的影响作用。利用欧洲群体中MAF>5%的胚系突变位点进行GWAS分析，发现 APOBEC3B 突变机制可以利用22q13.1预测，信号最强位点是rs12628403。该位点标记了常见的30kb胚系 APOBE3B 编码序列缺失和 APOBEC3B 的3’非翻译区域 APOBE3A 编码序列融合。除此，文章在22q13.1位置发现一个新的突变位点rs2142833，并验证其与 APOBEC3B 突变相关性。rs12628403和 rs2142833在欧洲群体中是独立遗传的，rs2142833是 APOBEC3B 的eQTL。 利用稀有突变（MAF<0.5%）分析欧洲群体中胚系蛋白截短体（PTVs）和体细胞DNA重排相关性。胚系BRCA2和BRCA1蛋白截短体和小于10kb的体细胞缺失和串联重复负荷相关。BRCA1蛋白截短体和模板插入具有显著相关。20/21个BRCA1相关肿瘤出现模板插入表型，且胚系突变和体细胞突变均发生在该基因上。说明 BRCA1 基因的次等位基因失活驱动模板插入SV表型。 稀有突变关联分析发现胚系MBD4蛋白截短体突变增加CpG位置的体细胞C>T突变。 MBD4 编码DNA修复基因，移除甲基化CpG上的T:G错配的胸腺嘧啶。 评估LINE调控体细胞反转座子事件，验证114个胚系LINE对体细胞反转座激活能力，包含70个人类基因组相关插入和53个连锁不平衡SNP。16个L1元件介导67%（2440/3669）的转座事件，以两种形式进行体细胞激活，称为Strombolian和Plinian；Strombolian在人群中分布频率较高，引发中小规模的体细胞L1激活；Plinian在群体中频率很低，引发严重的体细胞L1激活。 3.6复制的永生 癌症特征之一是逃避细胞衰老，保持端粒长度是癌症永久复制的因素之一。16%的肿瘤在 ATRX ,  DAXX 和 TERT 基因上发生突变。聚类端粒序列的12个特征得到4个肿瘤亚型，说明 ALT 和 TERT 介导的端粒变异的不同。 体细胞驱动突变在四个亚型中分布不同。C1主要富集 RB1 突变和影响 ATRX 的SV，C2主要富集 ATRX 和 DAXX 的体细胞点突变，C3样本主要发生 TERT 启动子突变。 RB 基因缺失与端粒延长相关。高频发生端粒异常机制的肿瘤主要由于组织中低复制活性。 总结 利用泛癌全基因组测序数据对驱动突变、结构变异、克隆进化以及转座子事件和端粒模式进行详细分析，绘制泛癌基因组特征和阐明引发癌症的多样性因素。 参考文献 ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium. Pan-cancer analysis of whole genomes. Nature. 2020, 578(7793): 82-93. 原文链接：

目前说是SCI，2017年IF为0.486

线粒体基因编辑现在只是处在简单的单个基因的编辑，并不能对它的作用有很大的改变就，依靠这种技术治病，还有很长的路要走。

题目： Zygnema circumcarinatum UTEX 1559 chloroplast and mitochondrial genomes provide insight into land plant evolution 轮藻 Zygnema circumcarinatum  UTEX 1559叶绿体和线粒体基因组为陆生植物进化提供了新见解 发表期刊： Journal of Experimental Botany  发表时间： 2020-3-24   影响因子： 5.36轮藻的完整叶绿体和线粒体基因组为陆地植物的陆生化提供了新的线索。在此，研究者报道了UTEX 1559的细胞器基因组，以及绿藻、轮藻和陆地植物的33个质体和18个线粒体基因组的比较基因组学研究。通过这些质体和线粒体基因组确定基因的存在/缺失。UTEX 1559 (157,548 bp)和SAG 698-1a (165,372 bp)质体之间的比较揭示了非常相似的基因，但是基因组发生了实质性的重排。令人惊讶的是，这两个质体只有85.69%的核苷酸序列一致性。UTEX 1559线粒体基因组大小为215,954 bp，是所有测序轮藻中最大的。有趣的是，这个大的线粒体基因组包含一个50 kb的区域，与任何其他细胞器基因组都没有同源性，其两侧是两个86 bp的正向重复序列，包含15个ORFs。这些ORFs与来自细菌和植物的蛋白质具有显著的同源性，具有诸如引物酶、RNA聚合酶和DNA聚合酶的功能。本研究结论为：(i)先前发表的SAG 698-1a质体可能来自不同的双星藻属 Zygnema 物种，以及(ii)UTEX 1559线粒体基因组中的50 kb区域可能是最近获得的可移动元件。 图1、两种 Z. circumcarinatum 藻种SAG 698-1a(上)和UTEX 1559(下)的MAUVE比对。结果显示了大量的重排和不同的质体长度，表明这些藻种可能不是同种的。A框显示了含有 ccsA 基因和 trnI 基因的区域，这是两个质体之间极少数保存完好的区域。B框显示了一个位于 ndhJ 基因和tRNA， trnL ( uag )之间的大区域，该区域是最大的区域(100kbp)，在该区域内共享保守的基因序列，但在位置上相对于其他区域非常显著地发生了重排。 图2、基于质体基因构建的系统发育图，热图代表基于基因GO的功能基因分组。 图3、基于线粒体基因构建的系统发育图，热图代表基于基因GO的功能基因分组。 图4、本研究包括的线粒体基因组的基因密度图。x轴为每个线粒体基因组中基因序列的百分比。y轴为物种。圆的大小为基因间间隔的百分比(IGS)。圆的颜色代表线粒体基因组大小。除了 A. thaliana 和 Z. circumcarinatum   UTEX 1559以外的所有物种都保持40%或更高的基因密度。UTEX 1559的基因密度为29.4%，不包括移动元件中的基因。当考虑移动元件中存在的额外基因时，UTEX 1559仍然保持低于40%的基因密度。 图5、UTEX 43 1559线粒体基因组中50 kb“基因沙漠”区域示意图。通过ORFfinder和序列相似性搜索，在该区域共发现16个基因(15个CDSs和1个tRNA)。