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怎样发表论文怎么生成分析

发布时间:2024-07-04 14:46:17

怎样发表论文怎么生成分析

研究生也是可以发表论文的,可以参考以下步骤1,筛选需要投稿的几个期刊,详细看看投稿要求,比如字符,引用率,参考文献等。2,根据期刊要求撰写论文,修改论文。3,投稿,等待杂志社审稿,检测等。4,杂志社会针对文章给出意见返修等,这个时候需要你修改。5,审核通过后,给杂志社缴费,6,等待出刊

发表一篇学术论文(特别是SCI、SSCI)不是一件很简单的事情,往往需要经历一个相对漫长的过程。对于科研新手而言,可能比较好奇发表一篇学术论文需要经过哪些步骤,今天就以理工科生发表SCI为例来谈一谈。第一步,数据收集要想发论文,首先得有拿得出手的东西,对理工科生来说,就必须有值得发表的数据,因此收集数据是发表一篇学术论文的第一步(此处忽略选题、文献调研等前期工作)。一般来说,理论性的论文可以将一些理论计算、仿真分析等结果作为数据,构成一篇论文;工程性的论文,往往需要实验数据,如果再结合一些理论分析(增加实验结果的可信度),会给文章加分不少。看过这么多文献,我发现比较牛逼的文章往往有深厚的理论分析。收集数据是第一步,也是最难、最耗时间的一步,因为你的数据是否漂亮一定程度决定了论文的创新性和价值。为了获得好的数据,好课题的重要性不言而喻,但更需要的是潜心钻研、经得住磨炼的精神。实验往往是残酷的,可能10次实验里前9次都是失败的,只有最后一次成功了,可能干脆全崩了,这时我们的心态也有可能跟着崩了。因此,不能害怕失败,就算失败了也要稳住心态,分析失败的原因,从而找出解决办法,一步一步完善实验。理论计算和仿真分析,有时比做实验更有挑战,因为往往只有具备深厚的数学和专业基础才能做好这一块,这不是一日之功就能完成的,往往需要长期的知识积累和很强的学习能力。当接触了一个新的方向时,我们对其理论背景往往不是非常熟悉,这时大量阅读文献,特别是英文书籍就很有必要,这个过程是痛苦且漫长的。第二步,数据处理/科研绘图数据很重要,数据分析也不能轻视。运用适当的数据分析方法有助于我们掌握数据的特点和内在规律,引发我们新的思考。因为论文的讨论(discussion)部分都是围绕数据展开的,数据的特点更丰富,值得说的点就更多,写起文章来也更容易。论文中的图(Figure)除了数据图还有示意图,炫酷的示意图能给论文增加不少印象分,相信审稿人看到一篇作图水平非常高的论文心情都会好很多吧。像CNS这种级别的论文的作图那叫一个赏心悦目,据说有个学者为了将一颗白菜的三维图做的更漂亮,买了一车的白菜来研究!因此掌握一定的数据处理/科研绘图能力非常重要,平时可以学一下相关的软件,知乎上有个相关的帖子打击可以点击“阅读原文”看一下。第三步,论文撰写数据处理好了,下一步自然就是撰写论文了。有了好东西,得把它说得漂亮才行,就像你开发了个好产品,但是卖得不好也没用。学术论文的结构总是差不多,相信文献看多了之后就发现,总是少不了摘要(abstract)、前言(introduction)、结果(results)、讨论(discussion)、总结(conclusion)等几个部分。在写论文初稿时,不要想着论文的排版,只管把该写的内容写下来就好(word单栏即可,或者LaTeX)。初稿完成后,再根据想要投稿的期刊的格式要求对论文进行排版,一般来说期刊会在官网提供投稿模板(template),按照要求修改格式即可。其实,投稿论文(manuscript)的格式要求和最后发表的格式往往并不一样,涉及到的都是一些比较简单的排版(字体大小、论文结构、图表等 ),因此完全不用为排版担心。因为发表前,期刊编辑会按照发表格式的要求对论文进行重新排版的。总之记住一点,写论文时把重点放在内容上,而不是格式上。论文撰写过程中,英文的表达非常重要,因此平时在文献阅读过程中,要养成积累优秀句型的习惯,做好笔记,拿来即用。前面有几期介绍过一些有助于论文写作的网站,如《论文写作时,堪称神器的网站!》。如果对自己的英文写作不够自信,最好请外国人或者相关的机构润色一下。论文写作过程中,还有一个非常重要的环节就是参考文献格式的书写。我发现身边很多人都会受这个困扰,花很多时间去琢磨如何排版参考文献。其实,有很多优秀的工具可以帮助我们做到这些,比如前面介绍的软件Zotero,后期我会专门讲解如何排版参考文献。

发表一篇论文的方式如下:

论文发表,一个是可以直接投稿杂志社,一个是可以通过论文代理机构。

费用方面,杂志社肯定要比代理便宜。因为,杂志社只是收取非常小部分的版面费。而代理方面,收取的比较多。

时间方面,杂志社的编辑一般很少自己采集稿件。毕竟,每个编辑其实都会跟很多代理合作。他们会直接从代理方面得到稿件,并且从中抽取部分好处费。代理手中的稿件比较多,所以杂志社的编辑们一般都非常乐于跟他们合作。

关键是,自己也能从中得到额外的收入,何乐而不为。 审稿方面,杂志社不是所有的稿件都给你发。当然,作为代理方,也不可能所有的稿件都能承诺给你发。但是,只要代理方面承诺可以发。那么,就百分之百可以发表了。

毕竟,只要是气候成熟的代理,都会固定的和一些杂志社编辑有长期合作。这样,就会无形中生成一种关系户的效果。

所以,审稿方面,找代理确实要比杂志社容易多。 也就是说,杂志社便宜是便宜,但是没有时间保证,审稿麻烦切周期长。而,代理方面,贵也贵不到哪儿去,审稿速度快,时间短。现在需要发表论文的作者,时间方面大多都比较紧迫,而且论文方面也都比较麻烦。

才发表论文怎么生成分析

你要分析什么数据都没说,让人怎么回答问题呢?如果是从来没用过Excel,那还是找个入门的课程先学习一下。如果是简单的Excel操作会用,在数据分析过程中遇到了困难,那就要把excel表格截图发出来,然后描述清楚具体遇到什么难题,这样其他人才有可能帮助你的。

用EXCEL对论文数据进行分析,不是不可以做。但是一定要把握几个原则,首先你得要走专业数据的标准,换句话说,假设你的某项指标的系数标准是0.5-0.8之间,你得要有标准,这样的话就可以进行分析!当然你得需要提供表格模板!让答辩者按照你的格式填写,你就可以用excel分析了!

1:excel虽然内置有数据分析模块,但是毕竟不是专业的数据统计分析软件,功能上受限很多。2:当然我们平时的大部分数据分析工作,无论是课程、毕业论文需要的,大家可能更习惯于使用专业的Eviews、SPSS、Stata、Minitab,甚至计量和统计科班的大神们都在用SAS、MATLAB或者R语言、Python语言。3:今天给大家推荐的两款excel数据分析插件内存小,内置于excel工具栏随点随用,仅仅包含常用功能,界面简洁。4:第一款6SQ统计是国内一家叫做六西格玛网的公司开发的,主要用于品质管理,不过常用的统计功能和数据分析模块都具备。一共有两个版本:开发版(收费)和个人版(免费),经过试用,两个版本功能差别不大。

用透视表分析一般的数据就可以了啊。步骤:插入——数据透视表——选定需要分析的数据,即可生成透视表。然后根据自己需要的数据进行布局,在树枝一栏中可以选择统计方式,比如求和、求平均、最大值、最小值等等。另外,如果因为专业原因需要进行更专业的数据分析,可以参考楼上的数据分析软件进行分析即可。以上问题来源于天猫博望专营服务店团队,希望可以帮到您。

怎样发表论文怎么生成

论文发表、投稿的流程如下:

一、投稿:

投稿是指论文发表人员选择好投稿期刊之后,我们再通过邮箱、在线投稿窗口、QQ或者微信等方式将自己的论文稿件发送给编辑就好了。

二、审核(也俗称为审稿):

投稿之后,编辑会按照投稿的先后顺序对论文进行一个审稿过程,有的期刊杂志是会收取审稿费的,如果我们发表论文需要加急发表的话,是需要在投稿时标注清楚的,这个可能会产生加急费用。

审稿环节是整个论文发表过程中耗时最长的,它可以说影响了论文发表周期的长短,只因为论文审稿可能会反复进行。

三、审稿结果:

审稿结果主要介绍通过审稿并被录用了的论文。通过杂志社论文三审的论文,杂志社会下发录用通知书,并注明好预安排在某年某期发表此篇论文,之所以是预安排,是因为还需要交纳版面费。

四、交费:

交费就主要指的是版面费了,在我们交纳费用之后,论文才会正式进入安排刊期出版的流程。

五、安排发表:

费用到位之后,便可以安排刊期了,并按照日期出版见刊。而少部分论文的发表可能会被延期,这样的现象也属于正常情况,原因就比如有人安排加急类似之类的问题。

六、寄送样刊:

论文见刊之后,杂志社会给作者寄送一本样刊的,是作为用途上交的材料。到此整个的论文发表流程就基本结束了。

在日常生活中,无论是评职称还是大学生毕业都离不开发表论文.在公开发行的学术期刊上发表论文,成为职称评选硬性条件之一,可以说发表论文,在职称评审中占据非常重要的作用.下面学术堂就来简单的说一下如何凭借个人经验发表论文.发表论文首先需要写一篇好的论文,论文不光主题鲜明,论点创新,还应该结构严谨,层次分明.与此同时,还应该注意论文标准格式、文句通顺,确保论文通过审核.发表论文流程主要包括以下几方面.根据杂志办刊盘方向以及办刊宗旨,确定要发表的刊物.然后投稿到杂志社邮箱,杂志社审稿录用排版印刷,到最后出版发行.如果稿件有问题会出现两种情况出现退稿与返修.返修的稿件要求整理好发回杂志社.觉得注意的是杂志社审稿在一周到一年不等根据杂志社实际情况来定排班时间在一周左右交稿三天左右印刷七到十天左右发行时间为一周左右.在进行发表期刊论文的过程中,要根据自己的实际情况选择合理的时间进行发表.个人如何发表论文.1、发表论文的重要性.不同的人发表论文的作用也不同:(1)评职称(晋升职称):研究生 毕业需要;教师 、医护人员 、科研院所的人员、企业员工 等 晋升高一级的职称时,发表期刊论文是作为一项必须的参考指标.(2)申报基金、课题 :教育、科技、卫生系统 每年申报的国家自然科学基金项目、其它各种基金项目、各种研究课题时,发表论文 是作为 基金或课题 完成的一种研究成果的结论性展示.(3)世界性基础领域的研究,比如在医学、数字、物理、化学、生命科学 等领域开展的基础性研究,公开发表论文 是对最新科技 科学研究成果、研究方法的一种展示和报道.以推动整个社会的科技进步等.(4)提升自身竞争力:本科生和研究生在校期间发表具有一定水准的论文,有助于提升个人学术素养,进入社会,也可能会有更高的起点.2、发布论文的流程.(1)确定自己的研究课题,验证其写作价值,如果具有一定价值,就着手开始筹备论文,第一次发表论文,可以多向前辈请教,多查阅一些资料文献,在前人的基础上寻找突破口,选题立意要新颖实用,不要为了写论文而写论文.(2)论文经过多次修改完善以后,接下来我们就可以准备发表论文,发表论文第一步就是要选择对应的期刊,如果稿件投向不合适的期刊可能会遭遇退稿和不公正评判.如何选择合适的期刊?在知网或其他数据库中检索本篇论文相关领域的期刊,查看期刊级别以及刊物号等,确保其为正规期刊,然后阅读其刊登发表过的论文,看自己的论文是否适合在这些期刊上发表,从中挑出2-3个期刊作为备选,进一步了解这些刊物的审稿周期、投稿费用、投稿要求等,从中选出将要投稿的1个期刊,联系期刊编辑将自己的稿件投递过去,然后等待审稿人员的回复.

聚类分析发表论文怎么样

聚类分析在企业网络营销中的应用论文

论文摘要:本文针对企业网络营销中的大量数据为基础进行数据的分析,依据数据挖掘技术中典型的聚类分析方法进行数据的处理,并以一个网络营销公司为例,对其客户信息进行了聚类分析,得到了一些有价值的信息,对于企业的营销策略的决策给与一定的支持。

论文关键词:聚类分系,网络营销,策略,客户关系

0前言

现代科学技术的迅猛发展,特别是在互联网的应用和开发上更加的迅速,企业必须通过网络对自己的产品加强宣传以增强自己的竞争力。客户是一个非常重要的、有价值的重要资源,现在如何更好地从数据库中挖掘出客户中有价值的信息,更好的培植和经营与有价值客户的关系,抛弃那些无利可图没有发展前景而且营销费用高的客户,并且可以针对不同价值的客户给与不同的政策同时制定出个性化的营销策略,这些才能够保证企业的生存发展。对于这一切数据挖掘无疑是行之有效的好方法之一。本文以一个网络营销公司为例,提出了一套可操作性的对客户价值评价方法,然后使用数据挖掘技术中比较常见和常用的聚类分析算法对客户信息进行聚类从而达到非常重要的信息并为企业在网络营销中提供决策依据。

1聚类分析

聚类(clustering)是对于数据挖掘技术是非常重要的一部分,现在也是数据挖掘技术中关键的一种。聚类的意义就是针对物理或逻辑上的数据对象的进行自动分类,最后将数据对象分为多个类或簇的过程。对于聚类结果要使得数据对象在同一个分类中具有最大的相似度,而在不同的类中具有最小相似度。聚类的现实意义就是在于可以将数据按照一定得关系进行自动的分类,事先不知道所有的数据对象共有多少类,通过算法的处理最后得到一个分类结果进行应用。譬如在市场研究领域中,特别是针对网络营销的企业或网站,从大量的网络数据进行分析聚类,可以讲客户分成不同的类别,针对这些类别不同的购买力和兴趣爱好来进行个性化的营销手段,提高企业的经济效益。目前研究人员大多针对于聚类分析算法的改进和完善进行研究,进而提高聚类分析的工作效率。著名的算法有:CLARANS,BRICH,DBSCAN,CURE,STING,CLIGUE和WaveCluster等。

2聚类分析应用于企业客户资源管理

现针对某电子商务公司进行分析,该电子商务公司的客户分布在全国各地以及国外一些地区,现仅列出具有代表性的10个大客户:吉林,黑龙江,山东,江苏,浙江,安徽,湖南,缅甸,印度,南非等。在数据挖掘的目的就是从客户中找到一些共同点,在对这些客户数据进行处理前要使用聚类分析的方法进行研究看看这10个客户能否有一些共同之处以便企业针对不同类型的客户给与不同的对策,首先对该公司采用专家打分的方法,而且还有通过网上问卷调查和访谈的方式,收集各地销售专员的意见等方式,然后对数据加以综合,最后聚类分析法确定各项指标的权重。

那么在具体实施聚类分析法的时候可分为5个步骤进行:

第1步:首先对各项指数构建层次结构,其中被评定的10个大客户作为方案层,客户价值放在目标层中进行处理,各项指标是准则层,按照这样的分层结构来构造客户关系评价系统中个指数的结构图,见图2-1所示;

从数据可以看出有两种情形:一是缅甸和南非,从数据中可看出这类客户的当前价值很小,但是具有很大的隐含价值,势必会有一天他们的成长给企业会带来丰厚的物质利益,这样具有发展潜能的客户应该采取措施激发潜能;二是安徽和印度这类客户,虽然从数据中看出这类客户当前价值很小,但是就这两个省份的地理位置和经济状况来分析他们隐含着较大的价值。对于这一类的客户,企业就应该采取灵活的措施,激发他们的购买能力促使该类型的客户不断地向前发展;

第2类是“维持型”客户,他们会源源不断的为企业提供利润,如黑龙江和江苏,他们这类客户根据以往的交易记录分析到得结果就是目前价值大,不过没什么发展的潜能,或者说在某种情况下它的时常还会萎缩,当前这类客户会给企业带肋比较丰厚的利润但是就长期发展而言却不是利润的主要来源,他们在某种情况下会流失掉,会被其他的企业竞争对手的介入而流失,为此对于企业一方面要维持与这类客户的良好关系,保持稳定的`客户关系,另一方面还要采取一些营销手段来刺激该类客户的消费,提供一些个性化的服务和策略;

第3类“淘汰型”客户,这类用户就如同鸡肋了,对于企业的现在和将来都意义不大,目前的销售份额较小,企业对他们营销的成本还很高,年利润率很低,根据分析这类客户包括浙江、湖南和吉林,他们没有长期的发展的趋势,所以企业采取的策略就是应充分挖掘他们给企业带来的当前价值后逐渐地放弃他们;

第4类是“贵宾型”客户,这类用户是企业的主要经济利润的来源,在某种程度上可以说是企业生存的保证,他对企业是关系到生死存亡的重要客户,从数据中看山东就是该企业的这类贵宾型的客户,他的当前价值和潜在价值都很大,企业必须认真对待,细心呵护与这类客户的关系,以及该客户企业的关键性人物的关系,加强与这类客户的沟通和关系的培养,同时还要提高警惕,防止竞争对手抢走这些贵宾型客户。针对贵宾型客户企业就应该对其进行一对一的营销策略,进行良好的客户需求沟通,尽最大可能满足他们的需求,适当给与一些特殊政策来加强和他们的关系。从不同角度来加强客户对企业的忠诚度、满意度等。企业根据这些重要的信息就可以针对不同的客户采取合适的销售策略。

3小结

总之,企业首先对客户的价值进行全方位、多角度进行评价,再将分析结果量化后进行数据挖掘,通过聚类分析,对客户进行细分,针对不同类型的客户给与个性化的服务。

问题一:聚类分析的意义是什么 科技名词定义中文名称:聚类分析 英文名称:cluster *** ysis 定义1:按照某种距离算法对数据点分类。 应用学科:地理学(一级学科);数量地理学(二级学科) 定义2:把观测或变量按一定规则分成组或类的数学分析方法。 应用学科:生态学(一级学科);数学生态学(二级学工) 聚类分析指将物理或抽象对象的 *** 分组成为由类似的对象组成的多个类的分析过程。它是一种重要的人类行为。聚类分析的目标就是在相似的基础上收集数据来分类。聚类源于很多领域,包括数学,计算机科学,统计学,生物学和经济学。在不同的应用领域,很多聚类技术都得到了发展,这些技术方法被用作描述数据,衡量不同数据源间的相似性,以及把数据源分类到不同的簇中。 问题二:数据挖掘,聚类分析算法研究的目的和意义是什么! 15分 图像分割 基本原理:根据图像的组成结构和应用需求将图像划分为若干个互不相交的子区域的过程。这些子区域四某种意义下具有共同属性的像素的连通 *** 。常用方法有: 1) 以区域为对象进行分割,以相似性原则作为分割的依据,即可根据图像的灰度、色彩、变换关系等方面的特征相似来划分图像的子区域,并将各像素划归到相应物体或区域的像素聚类方法,即区域法; 2) 以物体边界为对象进行分割,通过直接确定区域间的边界来实现分割; 3) 先检测边缘像素,再将边缘像素连接起来构成边界形成分割。 具体的阈值分割: 阈值分割方法分为以下3类: 1) 全局阈值:T=T[p(x,y)〕,即仅根据f(x,y)来选取阈值,阈值仅与各个图像像素的本身性质有关。 2) 局部阈值:T=T[f(x,y),p(x,y)],阈值与图像像素的本身性质和局部区域性质相关。 3) 动态阈值:T=T[x,y,f(x,y),p(x,y)],阈值与像素坐标,图像像素的本身性质和局部区域性质相关。 全局阈值对整幅图像仅设置一个分割阈值,通常在图像不太复杂、灰度分布较集中的情况下采用;局部阈值则将图像划分为若干个子图像,并对每个子图像设定局部阈值;动态阈值是根据空间信息和灰度信息确定。局部阈值分割法虽然能改善分割效果,但存在几个缺点: 1) 每幅子图像的尺寸不能太小,否则统计出的结果无意义。 2) 每幅图像的分割是任意的,如果有一幅子图像正好落在目标区域或背景区域,而根据统计结果对其进行分割,也许会产生更差的结果。 3) 局部阈值法对每一幅子图像都要进行统计,速度慢,难以适应实时性的要求。 全局阈值分割方法在图像处理中应用比较多,它在整幅图像内采用固定的阈值分割图像。考虑到全局阈值分割方法应用的广泛性,本文所着重讨论的就是全局阈值分割方法中的直方图双峰法和基于遗传算法的最大类间方差法。在本节中,将重点讨论灰度直方图双峰法,最大类间方差法以及基于遗传算法的最大类间方差法留待下章做继续深入地讨论。 参详《数字图像处理》工具:MATLAB或VC++ 问题三:聚类分析方法有什么好处 5分 聚类分析:将个体(样品)或者对象(变量)按相似程度(距离远近)划分类别,使得同一类中的元素之间的相似性比其他类的元素的相似性更强。目的在于使类间元素的同质性最大化和类与类间元素的异质性最大化。其主要依据是聚到同一个数据集中的样本应该彼此相似,而属于不同组的样本应该足够不相似。 常用聚类方法:系统聚类法,K-均值法,模糊聚类法,有序样品的聚类,分解法,加入法。 注意事项: 1. 系统聚类法可对变量或者记录进行分类,K-均值法只能对记录进行分类; 2. K-均值法要求分析人员事先知道样品分为多少类; 3. 对变量的多元正态性,方差齐性等要求较高。 应用领域:细分市场,消费行为划分,设计抽样方案等 优点:聚类分析模型的优点就是直观,结论形式简明。 缺点:在样本量较大时,要获得聚类结论有一定困难。由于相似系数是根据被试的反映来建立反映珐试间内在联系的指标,而实践中有时尽管从被试反映所得出的数据中发现他们之间有紧密的关系,但事物之间却无任何内在联系,此时,如果根据距离或相似系数得出聚类分析的结果,显然是不适当的,但是,聚类分析模型本身却无法识别这类错误。 问题四:聚类分析的结果分成几类,但是这几类有什么关系呢,这几类有什么含义。 5分 这个要看你是面对什么问题了,如:用聚类做财务舞弊,则会有以下几类:正常财务报表、虚增利润舞弊财务报表、关联交易财务舞弊报表等 问题五:SPSS新手求问聚类分析 聚类分析主要作用是把一些数据分成未知的几类这样理解对吗? 系统聚类的 建议买本spss的教程,可以更加系统的学习。要是写论文的话, 可以帮忙数据 he 分析。 问题六:主成分分析法和聚类分析法的区别 问题七:如何评价spss系统聚类分析结果? 用方差分析来判定聚类结果好坏,类与类之间是否差异性显著,呵呵~~ 问题八:聚类分析主要解决什么类型的实际问题 主要解决实现不知道类别标签的样本集的分类问题.聚类其实也是实现分类的功能.聚类和分类的区别:分类是用知道类别标签的样本集去训练一个分类器,然后用该分类器对其他未知类别的样本进行归类,由于训练分类器用到了知道类别的样本,所以属于有导师学习;聚类是完全不知道各个样本的类别,按照一定的聚类度量准则直接进行聚类,所以属于无导师的学习. 聚类可以用在图像处理,模式识别,客户信息分析,金融分析,医学等很多领域.用模糊聚类进行图像分割就是一个非常典型的应

生信分析怎么发表论文

(1)写好论文找到合适年底刊物投稿过去,关键是论文质量要过关,要跟你投稿的杂志方向匹配。(2)找论文发表机构投稿,这个比你自己投稿快一些,就是费用会贵一些。推荐一个靠谱的机构,淘淘论文网。其他机构不推荐,不靠谱的太多。

要写出自己的论文,并认真修改确保没有错误。这个过程只能靠自己的研究、学识和思想,或多读文献了。02确定想要投哪个期刊,无论国外还是国内的期刊都可以进行网上投稿,可以通过查找相近的论文是出自哪个期刊,进而确定自己想要投稿的期刊。03一般投稿都要求有版面费的,部分较好的期刊免收版面费,版面费通常在几百到几千元不等,国外有些顶尖期刊的版面费可高达数千美元。04通过网络搜索,找到该期刊的主页,都会有投稿信息,有些是需要网上注册,然后上传自己的文章,有些是要发到制定的邮箱;05经期刊部门审核后,会发出修改通知,或录用通知,或拒稿通知。如果是修改通知,需要按照给出的意见进行修改后重新投稿,拒稿通知的话,一般可以改投其他期刊,但也可以修改后重新投该期刊。论文收到录用通知后,会给出账户,要求把要求数额的稿费打到账户中。如果届时未缴纳稿费,会认为是撤回稿件。06切记,投稿要选择正规期刊投稿,现在不乏很多非正规期刊为敛财而虚假征稿的情况发生。

就有人问,生信的文章能发到多少分?如果你是像华科薛宇教授一样的大牛,弄一套算法,编一个生信分析工具,十几分妥妥的,引用量杠杠的。但是,那是大牛,一般来说,按「常规套路」出牌的这种生信分析文章分值在 0-2 分之间。但也有些不做实验的生信分析文章能发到个 4-5 分,那么生信分析的文章怎么样能达到一个比较高的层次呢?这里,我们给大家分享两篇文章来说一说一些进阶的文章思路,一篇是发表在我们的老朋友「Oncotarget」上的,另一篇是发表在「Journal of Proteome Research」(IF = 4.1)上的。先看 Oncotarget 这篇「Genomic expression differences between cutaneous cells from red hair color individuals and black hair color individuals based on bioinformatic analysis」,文章是做的黑色素瘤的两种不同表型的个体的差异基因的生信分析。Abstract 里说到 MC1R 这个基因的突变会导致高患癌率的 RHC 表型两种不同的表型,其中 RHC 表型会增加皮肤癌的发生率,那么 MC1R 的突变究竟影响了哪些基因?文章通过 PPI 网络分析,分别对比分析两个不同表型(RHC 和 BHC)的正常皮肤细胞和癌细胞中的差异基因。结果表明,在癌细胞的对比中没有差异,而在正常皮肤细胞中筛选出 23 个 hub 基因,并且其中 8 个基因异常表达,这一结果提示这 8 个基因的异常表达可能是 RHC 表型患癌风险提高的重要原因。这篇文章利用了 3 个数据包进行综合分析,从而得到了一个 novel 的结论,文章利用 GSE44805 中的差异基因构建 PPI 网络筛选 hub 基因,再利用别的数据包中的测序结果验证这些基因确实存在异常表达,多方验证说明自己生信分析结果是可靠的。虽然作者一点实验也没有做,但是从数据量还有可靠性上来说,可能比自己辛辛苦苦地做小样本量测序还要靠谱。文章中的分析方法(差异基因以及 PPI 分析)都是我们非常熟悉的。筛选出差异基因,将上调和下调的基因分别构建 PPI 网络,得到文中的 4 张图(不管怎么说,这图的颜值比上一期套路中分析的文章要高得多)。这张图的构建方法这里不再赘述小结这篇文章的方法完全是可以借鉴和复制的,难点在于找到足够多的具有相似性和可比性的数据结果,以及找到一个合适的切入点得到一个相对 novel 的结论。下面看 Journal of Proteome Research 上的这篇文章「Weighted Protein Interaction Network Analysis of Frontotemporal Dementia」。一看这流程图就觉得这文章是生信专业的人做的文章。(本宫上学的时候,就觉得我们生命学院的学生都是码农,生物信息专业、生物医疗工程、生物科学这些专业的人天天都在编代码,完全感受不出生物专业的气息。)这文章讲得啥咧,就是先选出 13 个种子基因,然后根据 PPI 数据库中蛋白质互作关系构建这 13 个种子基因的第一层网络结构。再以第一层网络为种子构建第二层网络结构(然后电脑就死机了)。然后分析第二层网络的拓扑学结构,从中筛选出 hub 基因(图中绿点表示最初的 13 个种子基因,蓝点表示第一层的基因)。在构建过程中,随着基因数量的不断增加,最先选出的 13 个种子基因未必就是后来的 hub 基因。文中还设置了对照组,并详细讲述了这 13 个种子基因的筛选方法。因为整个分析过程都是建立在生信分析的基础上,属于完全架空的,所以整个研究过程十分讲究逻辑上的严谨性。小结之所向大家介绍这篇文章,是觉得这种思路在生信分析的文章中可以借鉴,种子基因的选择可以通过临床上疾病中基因突变的概率来进行筛选,然后构建两层 PPI 网络,进行 GO,KEGG 分析,从而预测新的未知的疾病相关基因,如果后续能从别的数据包中得到表达量的验证或者是自己在临床样本中进行验证,那么整个文章的内容将会更加丰富。局限性:PPI 数据库中其实很多蛋白质互作结果是没有意义的,因为在实际生物体中很多蛋白质互作情况是不可能发生的,只有在实验人为干预情况下才会发生。

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