蛋白质科学与生活论文3000字

蛋白质科学与生活论文3000字

生态 的蛋白质我肯定好的

蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说，蛋白质约占人体全部质量的18%，最重要的还是其与生命现象有关。[1-2]蛋白质（protein）是生命的物质基础，是有机大分子，是构成细胞的基本有机物，是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。氨基酸是蛋白质的基本组成单位。它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。蛋白质占人体重量的16%~20%，即一个60kg重的成年人其体内约有蛋白质6~12kg。人体内蛋白质的种类很多，性质、功能各异，但都是由20多种氨基酸（Amino acid）按不同比例组合而成的，并在体内不断进行代谢与更新。

配制合理的饮食就是要选择多样化的食物，使所含营养素齐全，比例适当，以满足人体需要。 1．粗粮、细粮要搭配：粗细粮合理搭配混合食用可提高食物的风味，有助于各种营养成分的互补，还能提高食品的营养价值和利用程度。 2．副食品种类要多样，荤素搭配：肉类、鱼、奶、蛋等食品富含优质蛋白质，各种新鲜蔬菜和水果富含多种维生素和无机盐。两者搭配能烹调制成品种繁多，味美口香的菜肴，不仅富于营养，又能增强食欲，有利于消化吸收。 3．主副食搭配：主食是指含碳水化合物为主的粮食作物食品。主食可以提供主要的热能及蛋白质，副食可以补充优质蛋白质、无机盐和维生素等。 4．干稀饮食搭配：主食应根据具体情况采用干稀搭配，这样，一能增加饱感，二能有助于消化吸收。 5．要适应季节变化：夏季食物应清淡爽口，适当增加盐分和酸味食品，以提高食欲，补充因出汗而导致的盐分丢失。冬季饭菜可适当增加油脂含量，以增加热能 配制合理饮食的方法: ①根据具体情况（如性别、年龄、劳动强度），确定每日总热能及营养需要量。 ②根据碳水化合物（占60％～70％）、脂肪（占20％～25％）、蛋白质（占10％～15％）所占一日总热能的比例，分别计算其需要量。 ③确定每日需用的营养素后，根据食物所含的营养素计划每日膳食。 ④根据经济及供应情况确定每日供给主食和副食的数量。 ⑤最后计算出全部食物的各种营养素含量，并与供给标准相对照。若相差在±10％幅度内，即符合要求。 饮食应合理搭配 在社会物质比较丰富、科技水平日益提高的今天，怎样吃得更科学或者说更有益于健康，是当前人们关注的话题。有人将当前人们在饮食方面的追求，概括为“吃杂”“吃粗”“吃野”和“吃素”四大特点。从营养学角度来看，还是应该将这四大特点结合，合理搭配，可能会更符合人们对各种营养的需求，对中老年人来说，合理搭配显得更重要。 粗细搭配 科学研究表明，不同种类的粮食及其加工品的合理搭配，可以提高其生理价值。粮食在经过加工后，往往会损失一些营养素，特别是膳食纤维、维生素和无机盐，而这些营养素也正是人体所需要或容易缺乏的。以精白粉为例，它的膳食纤维只有标准粉的1/3，而维生素B1只有标准粉的1/50；与红小豆相比二者少得更多。因此，老年人在主食选择上，应注意粗细搭配。至于什么样的比例最好，目前还没有确切的资料，将来也不可能有，还是因人而异为好。不过，多吃杂粮的好处是显而易见的。例如小米和红小豆中的膳食纤维比精白粉高8倍～10倍，B族维生素则要高出几十倍，这对于增强食欲，防止诸如便秘、脚气病、结膜炎和白内障等都是有益的。我国很多地方的“二米饭”（大米和小米 ）、“金银卷（面粉和玉米面）”都是典型的粗细搭配的例子，是符合平衡膳食的要求的。 荤素搭配 动物油含饱和脂肪酸和胆固醇较多，应与植物油搭配，尤应以植物油为主（植物油与动物油比例为1∶2）。动物脂肪可提供维生素A、维生素D和胆固醇，后者是体内合成皮质激素、性激素以及维生素D的原料。据最新的研究报道，胆固醇还有防癌作用。每天进食少量动物油应是有益无害的。又如，老年人容易缺钙，不妨经常用鲜鱼与豆腐一起烹调，前者含有较多的维生素D，后者含有丰富的钙，将两者合用，可使钙的吸收率提高20多倍；鲜鱼炖豆腐，味道鲜美又不油腻，尤其适合老年人；而黄豆烧排骨，其蛋白质的生理价值可提高二三倍。再如，人们日常生活中最常见的蔬菜与肉类的搭配，如黄瓜肉片、雪菜肉丝和土豆烧牛肉等，由肉类提供蛋白质和脂肪，由蔬菜提供维生素和无机盐，不但营养素搭配合理，而且色泽诱人，香气四溢，更使人食欲顿增。 酸碱搭配 我国劳动人民在与自然界的长期斗争中，留下了很丰富的饮食文化，有待于用现代科学理论和技术去发掘、提高。比如，南方有些地区讲究把鳝鱼与藕合吃。原来鳝鱼含有粘蛋白和粘多糖，能促进蛋白质吸收和利用，它又含有比较丰富的完全蛋白质，属酸性食物；藕则含有丰富的天冬酰胺和酪氨酸等特殊氨基酸，以及维生素B12和维生素C，属碱性食物。这一酸一碱，加之两者所含营养素的互补，对维持机体的酸碱平衡起着很好的作用。实际上，我国人民长期以来所形成的烹调习惯，有很多是属于酸性食物和碱性食物搭配的。总的看来，动物性食物属酸性，而绿叶菜等植物性食物属碱性，这两类食物的搭配对人体的益处是显而易见的，也是荤素搭配的优点所在。因此，一些西方的科学家极力推广中国的菜肴搭配和烹调方式。一、食物多样，谷类为主，粗细搭配二、多吃蔬菜水果和薯类三、每天吃奶类、大豆或其制品四、常吃适量的鱼、禽、蛋和瘦肉五、减少烹调油用量，吃清淡少盐膳食六、食不过量，天天运动，保持健康体重七、三餐分配要合理，零食要适当八、每天足量饮水，合理选择饮料九、如饮酒应限量十、吃新鲜卫生的食物对我有帮助

蛋白质修饰过程中如何避免蛋白质失活的问题？

首先声明：本人未做过蛋白质修饰
不过从做化学的角度看，有以下两种手段：
1、首先利用底物类似物和蛋白结合，占住活性位点，然后再修饰蛋白，修饰后去除底物，保证活性中心不受影响。
2、更换反应方案，一般情况下蛋白中的半胱氨酸大多不是活性位点，采用巯基修饰可能更好些。

@3楼:没做过抗体，但是做过某些蛋白质的改性。裸露的lys上的氨基的反应活性最强，先确定好你的目标氨基。抗体重要区域的氨基是否裸露?活性是否很强?如果活性相当的话控制投料比可以保证一部分抗体保持活性，但是可能夹 ... 你好，请问如何查看抗体重要区域的氨基是否裸露?或者你们在做蛋白质的改性时是如何确定的?

@10楼:首先声明：本人未做过蛋白质修饰
不过从做化学的角度看，有以下两种手段：
1、首先利用底物类似物和蛋白结合，占住活性位点，然后再修饰蛋白，修饰后去除底物，保证活性中心不受影响。
2、更换反应方案，一般情况 ... 恩，有道理，谢谢

@2楼:没做过，个人想法：能否利用位阻效应 谢谢

蛋白质组学 & 修饰蛋白质组学 科学技术和职业生涯发展交流帖

@5楼:本人NK硕士期间做蛋白质组学，接触时间很短，只是从双向电泳+MALDI路线做起。现在工作中要使用ESI-Q-TOF做蛋白质组学的相关工作，还有很多不懂的地方。这个帖子让我把零散的理论知识总结了一下。以后还希望前辈多多 ... 楼上同道中人，关于2DE和MALDI-TOF质谱性能，我简单的在此贴里总结，也为其他人参考
1，2DE (双向凝胶电泳)&质谱鉴定蛋白的优劣：
   （1）2DE做蛋白组学通量太低，一般不超过1000，这大大限制了后续的生物数据挖掘；而质谱鉴定至少是在100-2000以上，目前使用Thermo QE,fusion可以做到4000+；
   （2）2DE重复性差，特别用银染，同样的样品不同次跑胶，可能结果都不一样，即使在某个胶点出现差异，也可能是假阳性，不能够确定其是否是由于操作问题，还是诊断有差异表达；
    （3）2DE鉴定到的蛋白，切胶进行单蛋白鉴定对蛋白纯度要求很高，一般要90%，最好是考马斯亮蓝染色，不然很容易鉴定不出来，也增加后续质谱鉴定难度；
    （4）耗时耗力，时间成本和失败后累计实验成本不低，2DE因此存在之前的问题，所以在实验技术稳定上需要花费大量的人力物力，而质谱技术样品制备完成，直接上质谱，基本一个星期就可以出结果，特别是在科研竞争激烈的今天，速度很重要，可能你还在摸索着调试2DE的体系，人家文章就已经发出来了。
       2DE在蛋白组研究初期的确起到促进研究作用，但是随着质谱技术的发展和改进，2DE的优势越来越小，已经逐步被取代。

2，MALDI-TOF 和ESI-MS质谱的区别：
(1)MALDI-TOF
     MALDI 的电离方式是Karas和Hillenkamp于1988年提出。MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶体，当用激光（337nm的氮激光）照射晶体时，基质分子吸收激光能量，样品解吸附，基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。它从固相标本中产生离子，并在飞行管中测定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽质量指纹图谱，非常快速（每次分析只需3~5min），灵敏（达到fmol水平），可以精确测量肽段质量。
  (2) ESI- MS是利用高电场使质谱进样端的毛细管柱流出的液滴带电，带电液滴溶剂蒸发，表面积缩小，表面电荷密度不断增加，直至产生的库仑力与液滴表面张力达到雷利极限，液滴爆裂为带电的子液滴，这一过程不断重复使最终的液滴非常细小呈喷雾状，这时液滴表面的电场非常强大，使分析物离子化并以带多电荷的离子形式进入
质量分析器。ESI-MS从液相中产生离子，一般说来，肽段的混合物经过液相色谱分
离后，经过偶联的与在线连接的高分辨质谱分析，给出肽片段的精确的氨基酸序列,但是分析时间一般较长。
     ESI-MS从性能稳定性，分辨率和鉴定样品的通路均高于MADI-TOF，前者可目前我们鉴定到的组学通量记录是 肿瘤细胞10,218个蛋白质； 水稻 8,124个蛋白质；  拟南芥7,560个蛋白质；足以看出其性能卓越；
目前ESI-MS代表的质谱：
Thermo Scientific的LTQ Orbitrap Elite
Thermo Scientific的Q-Exactive
是公认的现在市面上性能最好的质谱仪， Orbitrap是thermo的一个专利技术。

希望上述对做质谱和蛋白组的小伙伴们有所帮助

从今天起，我会陆续和大家分享有关PTM(Post-translational modification)组学的在众多生命科学和医学领域应用的科学Case，对从事蛋白质组和表观遗传，信号转导，基因表达调控等相关研究的科研工作者提供一个新的思路和参考。

一，乙酰化（acetylation）,乙酰化修饰主要是指在蛋白质肽链赖氨酸残基（Lysine）上被加了乙酰基，从而引起蛋白质的功能的变化，而组蛋白乙酰化是目前在表观遗传中研究的热点，在组蛋白（H3，H4，H2B ，H2A）的乙酰化直接和基因的转录激活和抑制是密切相关的。继表观遗传中DNA甲基化和MiRNA，LncRNA和histone modification将是未来生命科学又一轮研究热点和方向。
       而我们要深入研究某种修饰的机理和变化，就必须要涉及到调控修饰的酶和供体，对于乙酰化修饰来说，它的供体就是大名鼎鼎的乙酰辅酶A，也是细胞生理生化代谢中核心TCA循环中关键节点。调控乙酰化修饰的酶主要分为乙酰转移酶和去乙酰化酶（目前主要集中在组蛋白的调控没上）：
      1，组蛋白乙酰转移酶（Histone acetyltranerases，HATs）
          组蛋白乙酰化酶通过对组蛋白赖氨酸残基进行乙酰化修饰，减弱DNA与组蛋白之间的相互作用，辅助激活基因转录。组蛋白乙酰化酶主要分为以下几类：
          （1）G5 家族: 比如 KAT2a, KAT2b等。
           （2）ST (SAS/MOZ) 家族: 如 ST1, Kat5, ST2, ST3, ST4等。
           （3）SRC/p160 核受体共激活家族: 例如 NCOA1, NCOA3。
           （4）P300/CBP 家族: 如 p300, CBP。
       2，组蛋白去乙酰化酶（Histone  deacetylases，HDA）
           组蛋白去乙酰化酶主要承担组蛋白乙酰化修饰的清除，辅助抑制基因转录。它们一般均包含一个催化去乙酰化的结构域。一般参与组成多重复合物。HDA主要被分为四类：
            第I类: HDAC 1, 2, 3和 8；
           第II类: HDAC 4, 5, 7 和9，以及HDAC 6 和10；
            第III类: SIRT1 -7；
            第IV类: HDAC 11。
第I，II，IV类作用方式基本相同，而第III类是一类NAD+依赖性去乙酰化酶。去乙酰化酶主要作用是对乙酰化调控的基因表达进行负调控，调节各种生理活动的正常进行，乙酰化-去乙酰化动态调控异常也伴随疾病的发生。

      而目前很多药物都是针对组蛋白去乙酰化酶的（HDACi），当下发现的HDACi按其结构分为4类：
（1）脂肪酸，如丁酸盐、丁酸苯酯和丙戊酸，其中丙戊酸被用作抗癫痫药物；
（2）氧肟酸盐，如TSA是被发现的第1个能抑制HDA的天然氧肟酸，SAHA[4] 与TSA结构相似，是食品药品局批准的第1个可以用于临床的制剂；
（3）环肽，如天然产物缩酚酸肽FK-228、 apicidin和环氧肟酸；
（4）苯酰胺类，如MS-275、 M0103。有些HDACi如TSA、 SAHA属非选择性，可同时抑制Ⅰ类及Ⅱ类 HDA；有些 HDACi属于选择性的，如 MS-275对Ⅰ类HDA的抑制作用强于Ⅲ类HDA，而对HDAC6、 HDAC8几乎没有影响。但是现阶段对于决定不同HDA活性的组蛋白特异序列还知之甚少。
        
  3，乙酰化组学科学Case
      以上是关于乙酰化修饰的相关概述，而之前的研究主要是针对单个蛋白的乙酰化水平和调控进行研究，从组学层面上高通量的进行研究目前还很少,这极大的限制了我们对生命调控机理的研究，也阻碍了制药工业发展和疾病研究。  下面就乙酰化组学的应用和大家分享科学case.

    （1）原核乙酰化组解析

       1） 2013年1月，南开大学和PTM Biolabs合作针对大肠杆菌（）进行首次组学解析，首次在原核生物中发现349个乙酰化蛋白，定位了1070个乙酰化修饰位点，这是当时创造了原核生物中乙酰化组学世界纪录,文章发表在当年的《Journal of Pteome Research》(简称JPR)上。全面定位和找到原核生物中的乙酰化蛋白和修饰位点（组蛋白和非组蛋白），从而为基于原核生物的生命活动机制研究提供思路。    paper全文见本页附件2013.02-JPR-Comprehensive ...3.91 M

@2楼: 是TJU的前辈?

蛋白质组学正迎来黄金时期，现已成为生物研领域三大研究热点之一，前景光明!

蛋白活性问题，ph 对蛋白活性影响

你蛋白的等电点是多少?缓冲液pH要偏离蛋白等电点

PH，盐浓度都会影响蛋白的活性，这个只能试了，看什么条件下活性最高

@2楼:你蛋白的等电点是多少?缓冲液pH要偏离蛋白等电点 具体等电点，没有给我数据，因为涉及保密问题，我未接触到蛋白序列。不过可以可能 现在的ph 是偏离蛋白等电点的

@4楼:具体等电点，没有给我数据，因为涉及保密问题，我未接触到蛋白序列。不过可以可能 现在的ph 是偏离蛋白等电点的... 那就再看一下缓冲液缓冲体系是不是合适  还有盐浓度  你蛋白平时是怎么保存的呢?

另外  文献也不可全信~~~~

蛋白质生物信息学分析

分子量和等电点大小、亚细胞定位，一些同源基因的结构图、这些差不多了

请问你做二三级结构是用的什么软件呢?学习一下谢谢!

你好!我二级结构的用的是：
蛋白质二级结构（或检测）（热烈邀请大家补充）

(出处: 生物分子模拟论坛)
这里面提供了很多种方法，我试了试其中大部分的方法，你可以自己选择适合自己的。

三级结构的软件：
通过PHYRE 2 Ptein Fold Recognition Server和伦敦帝国理工学院3D LigandSite 三级结构及活性中心。
三级结构的我还没有确定，因为我有些内容还没有做完。