如何通过生物信息学发表论文

如何通过生物信息学发表论文

生物类的呗，医学类的呗，都是可以的，还可以看下在生物医学期刊上

生物类的，医学类的期刊都可以发啊

ncbi数据库主要有：核苷酸序列数据库 、基因组数据库、分子模型数据库、生物学门类数据库还有一些蛋白组学数据库等等。est数据主要指指不同组织的cdna序列，就是 包含各种表达序列标签（expressedsequencetags,ests）的数据库，一般用来识别基因，绘制基因图谱等。

最好先阅读几篇相应文章和相今似的论文，比如你的课题是油菜，你可以搜有关其他物种如小麦的。根据论文写作步骤制定实验计划。要练习使用一些常用软件，如NCBI,GenBank,在用时最好先下载安装有道词典，因为是英文网站，不容易懂，专业名词也太多！不要怕，万事开头难！好好准备，入了门就好了！

利用生物信息发表论文

生物类的呗，医学类的呗，都是可以的，还可以看下在生物医学期刊上

就有人问，生信的文章能发到多少分？如果你是像华科薛宇教授一样的大牛，弄一套算法，编一个生信分析工具，十几分妥妥的，引用量杠杠的。但是，那是大牛，一般来说，按「常规套路」出牌的这种生信分析文章分值在 0-2 分之间。但也有些不做实验的生信分析文章能发到个 4-5 分，那么生信分析的文章怎么样能达到一个比较高的层次呢？这里，我们给大家分享两篇文章来说一说一些进阶的文章思路，一篇是发表在我们的老朋友「Oncotarget」上的，另一篇是发表在「Journal of Proteome Research」（IF = ）上的。先看 Oncotarget 这篇「Genomic expression differences between cutaneous cells from red hair color individuals and black hair color individuals based on bioinformatic analysis」，文章是做的黑色素瘤的两种不同表型的个体的差异基因的生信分析。Abstract 里说到 MC1R 这个基因的突变会导致高患癌率的 RHC 表型两种不同的表型，其中 RHC 表型会增加皮肤癌的发生率，那么 MC1R 的突变究竟影响了哪些基因？文章通过 PPI 网络分析，分别对比分析两个不同表型（RHC 和 BHC）的正常皮肤细胞和癌细胞中的差异基因。结果表明，在癌细胞的对比中没有差异，而在正常皮肤细胞中筛选出 23 个 hub 基因，并且其中 8 个基因异常表达，这一结果提示这 8 个基因的异常表达可能是 RHC 表型患癌风险提高的重要原因。这篇文章利用了 3 个数据包进行综合分析，从而得到了一个 novel 的结论，文章利用 GSE44805 中的差异基因构建 PPI 网络筛选 hub 基因，再利用别的数据包中的测序结果验证这些基因确实存在异常表达，多方验证说明自己生信分析结果是可靠的。虽然作者一点实验也没有做，但是从数据量还有可靠性上来说，可能比自己辛辛苦苦地做小样本量测序还要靠谱。文章中的分析方法（差异基因以及 PPI 分析）都是我们非常熟悉的。筛选出差异基因，将上调和下调的基因分别构建 PPI 网络，得到文中的 4 张图（不管怎么说，这图的颜值比上一期套路中分析的文章要高得多）。这张图的构建方法这里不再赘述小结这篇文章的方法完全是可以借鉴和复制的，难点在于找到足够多的具有相似性和可比性的数据结果，以及找到一个合适的切入点得到一个相对 novel 的结论。下面看 Journal of Proteome Research 上的这篇文章「Weighted Protein Interaction Network Analysis of Frontotemporal Dementia」。一看这流程图就觉得这文章是生信专业的人做的文章。（本宫上学的时候，就觉得我们生命学院的学生都是码农，生物信息专业、生物医疗工程、生物科学这些专业的人天天都在编代码，完全感受不出生物专业的气息。）这文章讲得啥咧，就是先选出 13 个种子基因，然后根据 PPI 数据库中蛋白质互作关系构建这 13 个种子基因的第一层网络结构。再以第一层网络为种子构建第二层网络结构（然后电脑就死机了）。然后分析第二层网络的拓扑学结构，从中筛选出 hub 基因（图中绿点表示最初的 13 个种子基因，蓝点表示第一层的基因）。在构建过程中，随着基因数量的不断增加，最先选出的 13 个种子基因未必就是后来的 hub 基因。文中还设置了对照组，并详细讲述了这 13 个种子基因的筛选方法。因为整个分析过程都是建立在生信分析的基础上，属于完全架空的，所以整个研究过程十分讲究逻辑上的严谨性。小结之所向大家介绍这篇文章，是觉得这种思路在生信分析的文章中可以借鉴，种子基因的选择可以通过临床上疾病中基因突变的概率来进行筛选，然后构建两层 PPI 网络，进行 GO，KEGG 分析，从而预测新的未知的疾病相关基因，如果后续能从别的数据包中得到表达量的验证或者是自己在临床样本中进行验证，那么整个文章的内容将会更加丰富。局限性：PPI 数据库中其实很多蛋白质互作结果是没有意义的，因为在实际生物体中很多蛋白质互作情况是不可能发生的，只有在实验人为干预情况下才会发生。

较难的。看你的研究。所以Shirley将生物信息学研究。的水平划分成五个层次。此外，Shirley不区分生物信息学（Bioinformatics）和计算生物学，因此这两个概念不做区分。在这里咱再重复一遍，生物信息学和计算生物学的区别，0级 (Level 0)：为建模、而建模Shirley在博客里提到说“如果你记得功夫熊猫”，问题是我没记得这个，脑子里想的是《憨豆的黄金周》里那段nothing, nothing, nothing… 原博举的例子是，之前有人问：现在数据这么多，能建模的东西一大把，那我们该干点啥呢？Shirley就问：你想解决啥问题？答：建模的问题。

生物信息学和系统生物学是两个很有意义，也应该受到更多关注，采用的研究方法和研究领域，只要你选对了新颖有意义的研究方向，设计了非常严谨的实验，并且得到了令人信服的结果并描述得当，我想还是和其他领域的文章一样可以发表在顶级杂志的。如果科学家仅仅将自己当成数学家、统计学家、计算机科学家、物理学家，因为在这些学者各自的领域里，确实有许多好的理论建模问题。但如果这些学者是认真对待生物信息学的研究，这个回答不OK。许多0级生物信息学家们从来不读或者不发表生物学期刊上的论文，也不参加生物学的会议，因此这个级别属于“未入门级”。根据人以类聚，物以群分的原则，0级生物信息学家们通常只阅读自己或者其他0级生物信息学家的论文，并且，并且引用也是自引或者被同级别的学者引用。

研究生考试通过后如何发表论文

最好研一就开始准备，因为发表论文现在的周期挺长的，普刊在半年左右，核心期刊在一年以上。我个人不建议找论文中介发表论文，因为费用贵，还有就是如果自己投稿来得及就尽量自己投稿。查重20%内，论文字数4000-6000字，如果是发核心期刊得8000字。如果实在不得已想找论文网站快速发表，建议你先去淘淘论文网上了解下期刊知识，以免发到假刊上。

研究生毕业论文怎么发表哇，好就发表了些个人的一切诚意在论文上发表。

一、选择合适刊物必须要选择相同的专业才可以，二、在发表论文的过程中尽可能的去提前进行发表，省级刊物的发表周期一般在三到六个月左右的时间。三、在选择期刊的过程当中必须要了解刊物对，格式以及字数的要求，然后再开始撰写。四、选择投稿的方式有两种，一种是自己投稿，另外一种就是选择代理机构进行投稿。

1、首先确定选题。选题很重要，选择合适自己专业与发展的选择题。2、查阅资料，列提纲确定论文的内容。3、分析阅读你论文的对象的目的，善于应用图表表达完整信息。先列提纲（用来反应你的思路结构，征求别人意见）。4、写出草稿，写作时从最容易的地方入手（比如：仪器材料，实验方法，结果） 抽取有价值结果放入讨论，完成讨论，结论，引言。5、查阅资料，做试验，收集数据，写论文。6、写完论文，找导师查阅，修改。

如何通过知网检索论文文献信息

中国知网的检索方法有一框式检索、高级检索、专业检索、浏览检索、作者检索等多种，写出专业检索式进行检索的方法为“专业检索”，

在中国知网的专业检索方法的页面给出了专业检索式编写方法，具体查找步骤：

1、打开中国知网

2、点击右侧的“高级检索”

3、进入高级检索界面

4、点击上方的“专业检索”

5、可见“可检索字段”（字段代码）和“示例”

除此之外还会用到布尔逻辑算符、条件限定（如and、or、not等）等代码，即可编写专业检索式。

扩展资料：

检索介绍：1 快速检索：

提供了类似搜索引擎的检索方式，用户只需要输入所要找的关键词，点击“快速检索”就查到相关的文献。

2 标准检索：

在标准检索中，将检索过程规范为三个步骤：一输入时间、支持基金、文献来源、作者等检索控制条件；二输入文献全文、篇名、主题、关键词等内容检索条件；三对检索结果的分组排序，反复筛选修正检索式得到最终结果。

3 专业检索：

使用逻辑运算符和关键词构造检索式进行检索，用于图书情报专业人员查新、信息分析等工作。

4 引文检索：

以检索参考文献为出发点，根据文献的引用关系，找到引用文献。引文数据库中的所有文献都与其它文献具有引用或被引用的关系，引文检索是通过这些关系检索到文献。

5 “知网节”检索：

是基于文献知网节的作者、题名、关键词、摘要等特征信息，查找到重要文献知网节，最终找到与这些知网节相关的一组文献。

6 作者发文检索：

是通过作者姓名、单位等信息，查找作者发表的全部文献及被引下载情况。通过作者发文检索不仅能找到某一作者发表的文献，还可以通过对结果的分组筛选情况全方位的了解作者主要研究领域，研究成果等情况。

7 科研基金检索：

科研基金检索是通过科研基金名称，查找科研基金资助的文献。通过对检索结果的分组筛选，还可全面了解科研基金资助学科范围，科研主题领域等信息。

8 句子检索：

句子检索是通过用户输入的两个关键词，查找同时包含这两个词的句子。由于句子中包含了大量的事实信息，通过检索句子可以为用户提供有关事实的问题的答案。

9 知识元检索：

知识元检索是将文献总库中的学术术语、概念、数字、图形、表格等知识元信息抽取出来，为用户提供有关知识元的事实检索。

1、在知网官网搜索主题、关键词、题名等信息。

以搜索 Journalism 为例，可以看见搜索后有中文文献，也有英文文献，并且会显示数据库来源。

2、点击【外文文献】，就可以看到搜索词下的全部外文文献。

以 Journalism 为主题搜索下的外文文献截图。

3、知网可以自动识别中英文对应搜索内容。

以 新闻 为主题搜索下的外文文献截图。

方法二：

运用 CNKI学术搜索 。

中国知网与世界100多家国际出版社达成合作，整合出版了数百个重要的学术数据库，3亿多篇中外文文献。 比如爱思唯尔（Elsevier）。

1、在主页进行搜索，点击【全文获取】。

2、点击 Get Access ，可以看到数据库该文章是否免费开放下载权限，可以通过 Check Access 或者单独付费获得文章。

中国知网知识发现网络平台—面向海内外读者提供中国学术文献、外文文献、学位论文、报纸、会议、年鉴、工具书等各类资源统一检索、统一导航、在线阅读和下载服务。

中国知网即中国国家知识基础设施，是在教育部、中共中央宣传部、科技部、国家新闻出版广电总局、国家计委的大力支持下，由清华大学和清华同方发起，以实现全社会知识资源传播共享与增值利用为目标，始建于1999年6月的知识信息化建设项目。

在知网上查看论文方法如下：

用户需要先登录中国知网，然后在知网首页的检索栏中输入论文标题，点击检索后在论文页面下方点击手机阅读或者html阅读，系统自动完成扣费后，用户即可在知网全文查看论文内容。如果提示余额不足，就需要用户前往知网首页上方的充值入口，在充值界面中根据自己的需求充值一定的金额，充值完毕后返回文献下载页，点击下载按钮即可正常下载。

系统版本：Windows7，32位旗舰版，浏览器版本：Internet Explorer10 10·0·9200·17267，电脑型号：联想台式机天逸510S六核，电脑内存：2GB，处理器：intel（R）CPU，网址的话自己搜索浏览器进入官网即可，该方法适用与联想、苹果、神州、方正、戴尔等电脑品牌，但由于系统、软件版本各不相同，操作步骤存在小部分差异。

中国知网知识发现网络平台—面向海内外读者提供中国学术文献、外文文献、学位论文、报纸、会议、年鉴、工具书等各类资源统一检索的网站，查看论文十分方便。

生物信息学怎么发论文

生物类的呗，医学类的呗，都是可以的，还可以看下在生物医学期刊上

任何没有实验依据的结论，只能称作猜想

哪些论文可以发表在期刊生物信息学上如微生物高效菌能够将氰化物(氰化钾、氰氢酸、氰化亚铜等)分解成二氧化碳和氨；利用专门分解硫化物的微生物可以从废水中回收硫磺；利用能够降解石油烃的超级菌以清除油对水质的污染等。还可以将大量的微生物高效菌凝聚在泥粒上形成活性污泥，用来分解和吸附废水中的有毒物质，污水净化后沉积的污泥中存在丰富的氮、磷、钾等元素，是很好的有机肥料。3、大气污染的生物处理随着现代工、农业的发展，大量有毒、有害气体被排出，严重污染环境。

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